RARG及BMP15基因与从江香猪繁殖性能关联分析及表达规律研究

发布时间：2017-08-20 11:06

  本文关键词：RARG及BMP15基因与从江香猪繁殖性能关联分析及表达规律研究

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【摘要】：本研究以从江香猪为研究对象,选取视黄酸受体γ(RARG)基因和骨形成蛋白15(BMP15)基因作为影响从江香猪繁殖性能的候选基因,采用DNA混池、PCR直接测序及PCR-SSCP技术,对从江香猪的RARG基因、BMP15基因进行单核苷酸多态性研究,寻找与繁殖性状相关联的遗传标记;利用实时荧光定量PCR技术,对RARG基因、BMP15基因在从江香猪不同生长时期不同组织的mRNA表达水平差异进行分析,其结果如下:1.对RARG基因的研究表明,在受试群体中发现4个SNPs,可构建12种单倍型;关联分析发现,C1464T和C128T位点对从江香猪的繁殖性能存在显著影响(P0.05),等位基因C和等位基因A可能为从江香猪总产仔数、产活仔数、乳头数的有利等位基因,且CC基因型和AA基因型为有利基因型。2.对BMP15基因的研究表明,在受试群体中发现3个SNPs,且处于连锁不平衡状态,可构建6种单倍型;关联分析初步推断,BMP15基因C122T和A13G位点可能是影响从江香猪繁殖性能的2个分子标记,H3单倍型与CC、AB基因型分别为影响从江香猪母猪产仔数及乳头数的有利单倍型和基因型。3.实时荧光定量PCR检测发现,RARG基因和BMP15基因的mRNA在2、4、6、8、10月龄母猪的15种组织中均有表达,但不同月龄不同组织间存在表达差异;在从江香猪母猪卵巢、输卵管、子宫体及子宫角中,6月龄从江香猪比其他月龄香猪表现出较高的RARG基因mRNA表达量;但对于BMP15基因,5个月龄阶段的母猪卵巢、输卵管、子宫体、子宫角中的mRNA相对表达量均高于其它组织(P0.05),且在卵巢组织中的BMP15基因mRNA表达量随着母猪月龄增加呈逐渐递增的趋势。
【关键词】：从江香猪 RARG基因 BMP15基因 关联分析 多态性 表达
【学位授予单位】：贵州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S828
【目录】：

• 摘要7-8
• Abstract8-10
• 前言10-11
• 第一章 文献综述11-24
• 1 从江香猪资源概况11-14
• 1.1 中心产区及分布11
• 1.2 产区自然生态条件11
• 1.3 品种来源与变化11-12
• 1.4 品种特征12-13
• 1.5 品种保护与研究利用13-14
• 1.6 品种评价14
• 2 RARG基因研究进展14-17
• 2.1 RARG基因家族概况14-15
• 2.2 RARG基因结构和功能15-16
• 2.3 RARG基因调控机制16-17
• 2.4 RARG基因多态性及表达研究进展17
• 3 BMP15基因研究进展17-22
• 3.1 BMP15基因结构和功能17-19
• 3.2 BMP15基因调控机理19-20
• 3.3 BMP15基因多态性及表达研究进展20-22
• 4 目的与意义22-24
• 第二章 RARG基因与BMP15基因多态性研究24-57
• 1 试验材料24-26
• 1.1 试验动物24
• 1.2 试验仪器24-25
• 1.3 试剂及溶液配制25-26
• 2 试验方法26-37
• 2.1 DNA提取26-27
• 2.2 琼脂糖电泳检测27-28
• 2.3 DNA浓度和纯度检测28
• 2.4 DNA池构建28-29
• 2.5 引物设计及合成29-30
• 2.6 引物溶解与稀释30-31
• 2.7 PCR反应体系及条件31
• 2.8 DNA池PCR扩增及测序31
• 2.9 PCR-SSCP分析31-34
• 2.10 多态片段测序34
• 2.11 相关软件及统计方法34-37
• 3 结果与分析37-53
• 3.1 基因组DNA提取37
• 3.2 PCR扩增产物检测37-39
• 3.3 DNA池PCR产物测序结果39
• 3.4 RARG基因不同SNP位点遗传变异分析39-47
• 3.5 BMP15基因不同SNP位点遗传变异分析47-53
• 4 讨论53-57
• 4.1 RARG基因多态性与繁殖性状关联性分析53-54
• 4.2 BMP15基因多态性与繁殖性状关联性分析54-57
• 第三章 从江香猪RARG基因与BMP15基因表达规律研究57-83
• 1 试验材料57-58
• 1.1 试验动物57
• 1.2 主要仪器57
• 1.3 主要试剂57-58
• 2 试验方法58-62
• 2.1 总RNA提取58-59
• 2.2 第一链cDNA合成59-60
• 2.3 荧光定量PCR引物设计60-61
• 2.4 荧光定量PCR体系及反应程序61
• 2.5 建立标准曲线61-62
• 2.6 数据处理62
• 3 结果与分析62-78
• 3.1 总RNA提取及检测62-63
• 3.2 实时荧光定量PCR产物特异性及扩增效率分析63-65
• 3.3 RARG基因表达差异分析65-71
• 3.4 BMP15基因表达差异分析71-78
• 4 讨论78-83
• 4.1 RARG基因与BMP15基因RT-QPCR检测78-79
• 4.2 RARG基因表达规律研究79-80
• 4.3 BMP15基因表达规律研究80-83
• 第四章 结论与展望83-85
• 1 结论83
• 2 创新点83-84
• 3 展望84-85
• 参考文献85-91
• 致谢91-92
• 附录92-96

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本文编号：706235