绵羊生长候选基因克隆与组织表达及其SNPs与生长性状关联分析

发布时间：2017-08-22 14:35

  本文关键词：绵羊生长候选基因克隆与组织表达及其SNPs与生长性状关联分析

  更多相关文章： 绵羊 SPP1 LAP3 LCORL 生长性状 基因表达 SNPs 关联分析

【摘要】：本研究以绵羊6号染色体36.15~38.56 Mb区域内与生长相关的分泌性磷酸化蛋白基因(Secreted phosphoprotein 1,SPP1)、亮氨酸氨基肽酶基因(Leucine aminopeptidase 3,LAP3)和配体依赖的核受体辅阻遏物基因(Ligand dependent nuclear receptor corepressor like,LCORL)为目的基因,克隆了其完整或部分编码区序列,研究了其组织表达规律,并对其编码区SNPs与生长性状进行了关联性分析。结果如下:(1)克隆得到了绵羊SPP1基因完整编码区序列、绵羊LAP3基因和绵羊LCORL基因的部分编码区序列,长度分别为1122 bp、567 bp和1543 bp;预测绵羊SPP1基因编码产物可能作为一种分泌蛋白参与信号转导、转录和转录调控等生物学过程;绵羊LAP3基因可能参与信号传导、胁迫应答和转录调控等生物学过程;绵羊LCORL基因可能参与转录和转录调控等生物学过程。(2)绵羊SPP1、LAP3和LCORL基因在所研究的12种组织中均有表达,属广谱表达基因,SPP1和LAP3基因分别在中枢神经和十二指肠中表达量最高,LCORL基因在十二指肠和肺中表达量较高。(3)运用测序和PCR-RFLP的方法对绵羊SPP1、LAP3和LCORL基因编码区进行了SNPs扫描及其与生长性状关联分析。结果表明,绵羊SPP1基因中存在c.132AC突变位点,性状关联分析结果表明该突变位点与初生重和周岁重显著相关(P0.05),C等位基因为优势等位基因。LAP3基因中存在c.187 CG和c.1116 CT突变位点,其中c.187 CG突变位点与初生重、1月龄重和3月龄重呈显著相关(P0.05),与2月龄重呈极显著相关(P0.01);c.1116 CT突变位点与初生重呈极显著相关(P0.01),与1月龄重和2月龄重呈显著相关(P0.05);上述2个突变位点为C等位基因个体体重显著增大,CC型初生重、1月龄重和断奶重呈显著高于GG型(P0.05),C等位基因为优势等位基因。
【关键词】：绵羊 SPP1 LAP3 LCORL 生长性状 基因表达 SNPs 关联分析
【学位授予单位】：甘肃农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S826
【目录】：

• 摘要4-5
• Summary5-7
• 缩写词中英文对照表7-9
• 第一章 文献综述9-16
• 1 绵羊生长性状相关基因的研究进展9-13
• 1.1 GH基因的研究进展9-11
• 1.2 MSTN基因的研究进展11-12
• 1.3 Callipyge基因的研究进展12-13
• 2 与本研究相关基因的研究进展13-16
• 2.1 SPP1基因的研究进展13-14
• 2.2 LAP3基因的研究进展14-15
• 2.3 LCORL基因的研究进展15-16
• 第二章 试验研究16-63
• 1 试验材料与方法16-26
• 1.1 试验材料16-19
• 1.2 方法19-26
• 2 结果与分析26-57
• 2.1 绵羊SPP1、LAP3和LCORL基因的克隆及生物信息学分析26-44
• 2.2 绵羊SPP1、LAP3和LCORL基因的组织表达谱分析44-48
• 2.3 SPP1、LAP3和LCORL基因的SNPs检测及与体重的关联性48-57
• 3 讨论57-61
• 3.1 关于利用基因组数据库来克隆新基因57
• 3.2 关于绵羊SPP1、LAP3和LCORL基因的生物信息学分析57-59
• 3.3 关于绵羊SPP1、LAP3和LCORL基因表达59-60
• 3.4 关于基因的SNPs扫描与性状关联分析60-61
• 4 小结61-63
• 4.1 本研究获得的结果61
• 4.2 本研究的创新点与特色61-62
• 4.3 本研究的不足之处及进一步值得研究的工作62-63
• 参考文献63-72
• 致谢72-73
• 个人简介73-74
• 导师简介74-75

【参考文献】

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本文编号：719714