应用基因芯片筛选伊马替尼和尼洛替尼处理K562细胞表达差异基因

发布时间：2017-08-23 13:22

  本文关键词：应用基因芯片筛选伊马替尼和尼洛替尼处理K562细胞表达差异基因

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【摘要】：目的:探讨两种酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)处理K562细胞的基因表达谱变化,为认识慢性粒细胞白血病(CML)的发病机制、耐药机制提供新的思路,同时也为治疗寻找潜在重要靶标分子。方法:利用GEO数据库下载慢性粒细胞细胞系(K562)基因表达芯片数据,通过差异基因的筛选,趋势分析、GO分析,信号通路分析,最后获得的重要差异表达核心基因,并建立相互作用网络。结果:获得显著表达差异基因1000,通过趋势分析、功能富集分析及信号通路分析提示主要涉及到代谢途径、细胞凋亡、癌症的途径、细胞周期、p53信号通路。相互作用网络分析及同表达相互作用网络分析,得到重要的核心节点基因:AK2、ADSL、PKLR、PKM、SHMT2、ATIC、LDHA、ENO1、CTH、GOT1;YARS、CYP3A5、CTH、GYPA、ALAS2、MTHFD2、BLVRB、GUK1、CTSH、LMO2。结论:利用生物信息学的方法,分析慢性粒细胞白血病细胞基因芯片得到参与不同TKIs处理K562细胞的重要的细胞功能及信号通路主要涉及代谢通路及增殖凋亡信号途径,并且寻找到核心节点基因,为认识K562的耐药机制及治疗靶点提供新的思路。
【作者单位】： 解放军第四十四医院血液科;第四军医大学唐都医院血液科;
【关键词】： 慢性粒细胞白血病 尼洛替尼 伊马替尼 基因芯片
【基金】：贵州省卫生计生委科学技术基金项目(gzwjkj2014-1-058)
【分类号】：R733.72
【正文快照】： 前言 慢性髓性白血病(CML)是一种恶性造血干细胞疾病,其临床特点是染色体9和22之间的易位,BCR-ABL酪氨酸激酶抑制剂伊马替尼已成为新诊断的慢性粒细胞白血病首选治疗手段[1]。尼洛替尼是具有较高效能一个衍生物(二代TKI),在部分伊马替尼耐药的患者会选择使用[2],BCR-ABL突变

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5 罗依;谭亚敏;韩晓雁;朱晓黎;郑伟燕;谢万灼;张洁;叶t摻，

本文编号：725267