丝瓜过氧化氢酶基因CAT1的克隆及表达分析

发布时间：2017-08-26 14:17

  本文关键词：丝瓜过氧化氢酶基因CAT1的克隆及表达分析

  更多相关文章： 丝瓜 褐变 CAT 基因克隆 实时荧光定量PCR

【摘要】：采用RT-PCR和RACE技术从普通丝瓜果肉中分离到1条长达1 755 bp的cDNA序列,并对其进行序列分析。结果表明,该序列包含1个1 479 bp的开放读码框(ORF);预测编码492个氨基酸,理论分子量为56.98 kD,等电点为7.126;编码的蛋白与黄瓜(Cucumis sativus)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和萝卜(Raphanus sativus)同源蛋白的相似性均在92%以上,显示其高度的保守性,将基因命名为Lc CAT1,Gen Bank登录号为:KP222260。Wolf Psort预测其亚细胞定位于过氧化物酶体(Peroxisomal)内;Motif Scan分析显示,蛋白氨基酸序列344~352位和54~70位分别为过氧化氢酶近端血红素—配体及血红素活性位点特征序列,推测其属于典型过氧化氢酶类(typical catalase,t CAT)。荧光定量PCR分析显示,Lc CAT1具有组织表达特异性,在普通丝瓜品种‘福丝3号’叶片中表达量最高,将近为花、果实、根和茎中表达量的5倍。Lc CAT1在所选的6个丝瓜品种的果肉中呈差异表达,普通丝瓜中的表达量均高于有棱丝瓜;在普通丝瓜品种‘福丝3号’鲜切及采后储藏褐变过程中随时间增加而呈现上调表达趋势,且与其酶活性的变化趋势基本一致。Lc CAT1可能在丝瓜果肉褐变产生过程中发挥着一定的调控作用。
【作者单位】： 福建省农业科学院作物研究所福建省农业科学院蔬菜研究中心福建省蔬菜工程技术研究中心;
【关键词】： 丝瓜 褐变 CAT 基因克隆 实时荧光定量PCR
【基金】：福建省属公益类科研院所基本科研专项(2014R1026-11,2015R1026-9,2014R1026-6) 福建省农业科学院创新团队PI项目(2016PI-40);福建省农业科学院青年人才创新基金项目(2015QC-6)
【分类号】：S642.4
【正文快照】： 丝瓜分为有棱丝瓜(Luffa acutangula Roxb.)和普通丝瓜(L.cylindrical Roem.)两个栽培种,前者主要分布在广东、广西、海南等地区,其他地区则以普通丝瓜为主(苏小俊,2009)。有棱丝瓜果肉在烹饪过程中保持翠绿,不易褐变,口感也好(宋波,2008)。普通丝瓜果肉在其鲜切后及烹饪过程，

本文编号：741874