谷子CO家族基因的全基因组鉴定与分析

发布时间：2017-08-31 06:26

  本文关键词：谷子CO家族基因的全基因组鉴定与分析

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【摘要】：抽穗开花是高等植物从营养生长向生殖生长转变的过程,该过程受到众多基因的调控。CONSTANS(CO)是光周期开花途径中的一个关键基因,是生物节律钟基因和开花基因之间的关键枢纽。利用生物信息学的方法,从谷子基因组中鉴定了34个CO基因;与拟南芥CO家族的17个成员进行同源比对,发现Seita.7G007800与Seita.9G020100相似性最高;在此基础上,分析了谷子CO基因的启动子,发现启动子有光响应元件Sp1、脱落酸响应元件ABRE以及赤霉素响应元件P-box等;RNA-Seq转录组测序发现,这些CO基因在叶片中表达量存在显著差异,其中,Seita.4G192300基因表达量最高,而Seita.1G304900,Seita.3G080700和Seita.4G001600这3个基因在叶片中不表达。这些结果不仅为深入研究CO基因与抽穗开花的关系提供依据,而且为后续谷子抽穗开花途径的研究奠定理论基础。
【作者单位】： 山西农业大学文理学院;山西农业大学研究生院;山西农业大学生命科学学院;
【关键词】： 谷子 全基因组 CONSTANS 光周期途径 抽穗 开花
【基金】：山西省回国留学人员科研资助项目(2015-067) 山西省留学回国人员科技活动择优资助项目(2014-11)
【分类号】：S515
【正文快照】： 谷子(Setaria italica)是禾本科狗尾草属植物,具有抗旱性强、耐贫瘠等优点,广泛种植于干旱和半干旱地区。2012年,由美国国家能源部所属的联合基因组研究所和中国华大基因分别进行的豫谷1号和张谷的全基因组测序工作相继完成,从此谷子功能基因组学研究进入了一个新的时代[1-2]

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本文编号：763980