水稻干尖线虫翻译控制肿瘤蛋白基因的克隆及表达分析

发布时间：2017-08-31 12:47

  本文关键词：水稻干尖线虫翻译控制肿瘤蛋白基因的克隆及表达分析

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【摘要】：根据转录组测序结果,结合RT PCR及RACE技术,从水稻干尖线虫中克隆出翻译控制肿瘤蛋白(The translationally controlled tumor protein,TCTP)基因Ab TCTP。该基因序列全长810 bp,开放阅读框长度为546 bp,编码181个氨基酸,预测蛋白相对分子质量为20 930,等电点为4.68;Ab TCTP蛋白属于稳定性蛋白,没有信号肽和跨膜区域,亚细胞定位于细胞核中;该蛋白功能区域的氨基酸序列较为保守,含有TCTP保守结构域,属于TCTP超家族(TCTP superfamily)。多序列比对分析结果表明,Ab TCTP蛋白与秀丽隐杆线虫TCTP蛋白(XP_003112086.1)的覆盖度为100%,相似度为78%。系统进化树分析结果表明,该蛋白与秀丽隐杆线虫TCTP蛋白(XP_003112086.1)在同一分支上,亲缘关系较近。原位杂交试验结果显示,杂交处理后的线虫在其食道腺附近颜色加深,TCTP基因主要在水稻干尖线虫的食道腺附近表达。利用鱼藤酮对水稻干尖线虫进行药剂处理试验,24 h时LC50值为2.20μg/m L。实时荧光定量PCR结果显示,鱼藤酮处理12 h和24 h后,TCTP基因的表达均上调,且处理24 h时的表达量大于处理12 h时的表达量。推测该基因参与了水稻干尖线虫的应激反应。
【作者单位】： 东北林业大学林学院;
【关键词】： 水稻干尖线虫 翻译控制肿瘤蛋白基因(TCTP) 基因克隆 原位杂交 基因表达
【基金】：国家自然科学基金项目(31570637) 黑龙江省自然科学基金项目(ZD201404) 中央高校基本科研业务专项基金项目(2572015AA09;2572015EY02;DL13BA01;2572015CA09)
【分类号】：S435.111.48
【正文快照】： 翻译控制肿瘤蛋白(the translationally controlled tumor protein,TCTP)又名P21[1]、P23[2]、HRF[3]和Fortilin[4],是一类广泛存在于各类真核生物中且在进化上高度保守的蛋白[5 10]。因其在鼠腹水瘤细胞中的表达量高于在正常细胞中的表达量,且在翻译水平上受到高度调控,Gros

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本文编号：765692