蓖麻DNA甲基转移酶序列与基因表达分析

发布时间：2017-08-31 20:03

  本文关键词：蓖麻DNA甲基转移酶序列与基因表达分析

  更多相关文章： 蓖麻 DAN甲基转移酶 甲基化 生物信息学 基因表达

【摘要】：植物DNA甲基化是与调控基因表达、保护基因组免受逆境胁迫等相关的表观遗传现象,其中关键酶DNA甲基转移酶催化DNA序列维持甲基化和从头甲基化。本研究基于蓖麻全基因组、利用生物信息学分析方法、结合转录组数据和RT-PCR半定量表达分析,鉴别出蓖麻DNA甲基转移酶氨基酸序列的结构特征、系统发生和表达形式。结果如下:通过同源序列BLAST从蓖麻基因组数据库中获得8个DNA甲基转移酶基因;系统进化分析将8个蛋白分为4个亚家族:2个MET同源蛋白、2个CMT同源蛋白、3个DRM同源蛋白和1个DNMT2同源蛋白,进一步发现DNA甲基转移酶在系统进化上较为保守,分化发生在单双子叶植物分化之后;亚细胞定位分析发现8个DNA甲基转移酶都定位在细胞核中;蛋白结构域比对结果显示8个蛋白的C端催化结构域都有6个保守motif参与甲基化修饰催化功能,表明蛋白具有基本的催化甲基化功能,而N端调节功能域的差异将蛋白分为四类,其中Rc DNMT2缺少N端调节结构域;结合转录组数据和RT-PCR半定量表达分析发现蓖麻DNA甲基转移酶基因(除Rc DRM2外)在发育胚乳中相对其他检测组织高表达,推测是该时期的胚乳低甲基化诱导甲基化基因高表达。该结果有助于全面了解蓖麻DNA甲基转移酶特征及为从表观遗传深入开展蓖麻品种改良具有重要理论指导作用。
【作者单位】： 云南省农业科学院经济作物研究所;
【关键词】： 蓖麻 DAN甲基转移酶 甲基化 生物信息学 基因表达
【基金】：云南省重点新产品开发专项(2016BB005)
【分类号】：S565.6
【正文快照】： between different subfamilies,meanwhile,the lacking N-terminal domain presented in the Rc DNMT2.Phylogenetically,the MET,CMT,DRM and DNMT2 were conservative and differentiated after mono-and dicot-cotyledon.The expression level of all genes in developing

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前8条

1 邱丽俊;刘爱忠;;我国优势油脂类生物柴油植物蓖麻的种质资源发掘和生物柴油利用[J];生命科学;2014年05期

2 代梦媛;敖涛;徐伟;刘爱忠;;蓖麻DNA糖基化酶的序列与基因表达分析[J];中国油料作物学报;2014年02期

3 孙振钧;吕丽媛;伍玉鹏;;蓖麻产业发展:从种植到利用[J];中国农业大学学报;2012年06期

4 张美善;刘宝;;植物胚乳发育的表观遗传学调控[J];植物学报;2012年02期

5 ;Plant genomic DNA methylation in response to stresses: Potential applications and challenges in plant breeding[J];Progress in Natural Science;2009年09期

6 赵元茵;王元忠;曹念;周度金;李渝萍;;核定位信号及其分析策略[J];中国生物化学与分子生物学报;2009年08期

7 陈欣;王子成;;植物DNA甲基转移酶[J];生命的化学;2009年04期

8 朱志伟;杜文书;胡国胜;;蓖麻油深加工产物——尼龙11的合成及应用[J];中国油脂;2007年03期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 徐惠云;王盼忠;;晋北高寒区不同燕麦品种生长特性比较研究[J];中国农学通报;2016年27期

2 刘帆;袁玉顺;杨俊青;蔡秋华;李国强;吴显成;李江;张睿;;大麦新品系高产稳产性评价方法比较[J];云南农业大学学报(自然科学);2016年04期

3 傅晓艺;李彩华;赵彦坤;史占良;郭进考;何明琦;;小麦新品种‘石麦22号’丰产性、稳产性及适应性分析[J];中国农学通报;2016年21期

4 ZHANG Pan-pan;SONG Hui;KE Xi-wang;JIN Xi-jun;YIN Li-hua;LIU Yang;QU Yang;SU Wang;FENG Nai-jie;ZHENG Dian-feng;FENG Bai-li;;GGE biplot analysis of yield stability and test location representativeness in proso millet(Panicum miliaceum L.) genotypes[J];Journal of Integrative Agriculture;2016年06期

5 陈新;吴斌;张宗文;;燕麦种质资源重要农艺性状适应性和稳定性评价[J];植物遗传资源学报;2016年04期

6 曹玉杰;吴兴富;肖炳光;徐海明;;清香型产区烤烟品种经济性状环境稳定性[J];浙江大学学报(农业与生命科学版);2016年03期

7 吴昌湛;韦汉文;苏明;陈灿;吴春玲;李战;黄世旅;陈庆政;谭丹;唐荣华;;用GGE双标图分析贺油花生品种产量稳定性及试点代表性[J];中国油料作物学报;2016年01期

8 蔡丽娟;陈莹;李洋;;毕节市七星关区杂交玉米品种筛选试验研究[J];现代农业科技;2016年02期

9 齐慧冬;齐照明;侯萌;李伟;刘春燕;蒋洪蔚;胡振帮;陈庆山;;基于GGE双标图的大豆油分多环境的稳定性分析[J];大豆科学;2016年01期

10 赵世锋;曹丽霞;石碧红;张新军;李云霞;李萌萌;郭明;;国内主要莜麦品种在冀北坝上的适应性评价[J];农学学报;2016年01期

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 李亚杰;白江平;张俊莲;王蒂;;甘肃省马铃薯区试产量数据的AMMI模型分析[J];干旱地区农业研究;2013年01期

2 李玉发;王佰众;张学军;刘红欣;栾天浩;窦忠玉;赵德;何中国;;AMMI模型在花生区试数据分析中的应用[J];吉林农业科学;2012年06期

3 卢林;朱智伟;段彬伍;;利用AMMI模型分析我国杂交籼稻整精米率[J];中国水稻科学;2012年05期

4 冀建华;刘光荣;李祖章;刘益仁;侯红乾;刘秀梅;李絮花;罗奇祥;;基于AMMI模型评价长期定位施肥对双季稻总产量稳定性的影响[J];中国农业科学;2012年04期

5 严威凯;;双标图分析在农作物品种多点试验中的应用[J];作物学报;2010年11期

6 苏振喜;赵国珍;廖新华;世荣;蒋聪;朱振华;邹茜;;云南粳型特色软米食味品质性状稳定性分析[J];中国水稻科学;2010年03期

7 杨金华;程加省;于亚雄;许云祥;;不同栽培方式对大麦叶片性状的影响[J];西南农业学报;2010年01期

8 陈四龙;李玉荣;程增书;刘吉生;;用GGE双标图分析种植密度对高油花生生长和产量的影响[J];作物学报;2009年07期

9 施万喜;;利用AMMI模型分析陇东旱地冬小麦新品种(系)丰产稳产性[J];干旱地区农业研究;2009年03期

10 林华;高金锋;高小丽;冯佰利;党根友;柴岩;;不同基因型芸豆品种丰产性及稳定性分析[J];干旱地区农业研究;2009年02期

【相似文献】

中国重要会议论文全文数据库 前6条

1 李文学;陈雯;;DNA甲基转移酶[A];第五届广东省环境诱变剂学会暨第三届广东省预防医学会卫生毒理专业委员会学术交流会论文集[C];2006年

2 韩丽;范高超;沈清明;姜立萍;朱俊杰;;基于能量转移策略构建的高灵敏DNA甲基转移酶光电化学传感[A];中国化学会第29届学术年会摘要集——第04分会：纳米生物传感新方法[C];2014年

3 刘文斌;刘晋yN;敖琳;周紫垣;周燕虹;崔志鸿;曹佳;;大鼠肺鳞癌癌变过程中DNA甲基转移酶表达水平的动态研究[A];中国环境诱变剂学会第14届学术交流会议论文集[C];2009年

4 王上上;施伟民;;DNA甲基转移酶对系统性红斑狼疮发病的影响[A];中华医学会第14次全国皮肤性病学术年会论文汇编[C];2008年

5 李渊;武淑兰;卜定方;朱燕;朱强;曹香红;;急性白血病/骨髓增生异常综合征患者DNA甲基转移酶亚型的表达[A];第九届全国实验血液学会议论文摘要汇编[C];2003年

6 顾松;;DNA甲基转移酶异常剪接体DNMT3B7对神经母细胞瘤相关基因表达及细胞增殖影响的研究[A];中华医学会第八次全国小儿外科学术会论文集[C];2010年

中国硕士学位论文全文数据库 前9条

1 杨娟;辛伐他汀对急性髓系白血病NB4细胞株DNA甲基转移酶的影响[D];山东大学;2015年

2 崔竞红;孕鼠脂多糖暴露致子代肾脏组织DNA甲基转移酶表达变化的初步研究[D];第三军医大学;2015年

3 王超;DNA甲基转移酶在TGF-β诱导EMT中的功能研究[D];浙江大学;2015年

4 周将;外周血PBMC中DNA甲基转移酶及CD11a mRNA表达在ANCA相关性小血管炎发病作用的研究[D];广西医科大学;2014年

5 张勇燕;邻苯二甲酸二丁酯宫内暴露下的多代雄性生殖毒性及睾丸DNA甲基转移酶的改变[D];第三军医大学;2009年

6 叶振;DNA甲基转移酶在胃癌及癌前病变中的表达及意义[D];天津医科大学;2009年

7 张春娇;可卡因诱导脑内成瘾相关核团DNA甲基转移酶表达改变的研究[D];吉林大学;2012年

8 廖方伟;激活素A调控肿瘤细胞的增殖与DNA甲基转移酶（DNMTs）表达的相关性研究[D];吉林大学;2015年

9 龙春兰;DNA甲基转移酶（DNMTs）在小鼠胚胎着床中的功能研究[D];重庆医科大学;2011年

，

本文编号：767610