鼠伤寒沙门菌婴幼儿分离株耐药基因及毒力基因研究

发布时间：2017-08-31 23:05

  本文关键词：鼠伤寒沙门菌婴幼儿分离株耐药基因及毒力基因研究

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【摘要】：目的基于全基因组测序结果,分析鼠伤寒沙门菌耐药表型和耐药基因的关系,研究其耐药发生机制和毒力因子。方法利用美国临床和实验室标准委员会(CLSI)推荐的微量肉汤稀释法对5岁以下腹泻患儿粪便中分离的321株鼠伤寒沙门菌开展药物敏感性试验,从中选择不同耐药表型的3株鼠伤寒沙门菌(S1:敏感;S2:TET耐药;S3:ESBLs阳性,10重耐药)进行全基因组测序,通过与抗生素抗性基因数据库(ARDB)和病原毒力因子数据库(VFDB)比对以及美国国立生物技术信息中心(NCBI)核酸数据库人工检索,对耐药基因和毒力基因进行注释。结果 321株鼠伤寒沙门菌对IPM和MEM均敏感,对TET和AMP的耐药率最高,分别为84.4%(271/321)和83.8%(269/321),206株菌株显示为耐3类以上抗生素(64.2%,206/321),11株CIP-CTX耐药株均为ESBLs阳性(3.4%,11/321);全基因组测序结果显示,S1、S2和S3的全基因组大小依次为4 876 427、4 970 690、5 133 380 bp,预测编码基因数分别为4 825、4 936和5 082个,GC含量依次为52.18%、52.14%、51.87%;对S1、S2和S3基因组中18、20和32个耐药基因进行注释,除共有基因外,S2主要携带tet A和sul2基因,S3主要携带sul1/2/3、tetB、AAC(3)-IV、AAC(6')-I、ANT(2″)-I、ANT(3″)-I、aph A1、bla_(CTX-M-14)、bla_(OXA-1)、catB3、cml_e1和cml_e3基因。与阳性鼠伤寒沙门菌株LT2的gyr A基因进行序列比对发现,S3 gyr A基因第87位密码子由GAC突变为AAC(Asp87→Asn);分别注释S1、S2和S3基因组的130、129和120个毒力基因,发现主要以三型分泌系统和粘附因子为主。结论 5岁以下腹泻患儿粪便样品中鼠伤寒沙门菌耐药现象严重;全基因组测序分析发现耐药基因与耐药表型一致,且存在多种毒力因子;为后续开展耐药基因传播机制和菌株致病性研究,评估其对人群的健康风险,防控鼠伤寒沙门菌感染提供技术支持。
【作者单位】： 国家食品安全风险评估中心卫生部食品安全风险评估重点实验室;上海市疾病预防控制中心;
【关键词】： 腹泻 婴幼儿 鼠伤寒沙门菌 耐药基因 毒力基因 全基因组测序 食源性致病菌
【基金】：北京市自然基金项目(5141002) 2016高层次人才队伍建设项目(2016人才-3-14)
【分类号】：R446.5;R440
【正文快照】： 鼠伤寒沙门菌(Salmonella typhimurium)属于非伤寒沙门菌属,Kauffmann-White-Le Minor Scheme已公布的2 610余种沙门菌血清型中[1-2],鼠伤寒沙门菌是最常见的肠道沙门菌血清型之一,其导致的食源性疾病已成为全球重要公共卫生问题[3]。1988—2000年国际上发生的4 093起微生物食

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本文编号：768442