鹅掌楸DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆及表达分析

发布时间：2017-09-07 01:27

  本文关键词：鹅掌楸DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆及表达分析

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【摘要】：棕榈酰化修饰是一种最普遍且唯一可逆的翻译后脂质修饰方式,赋予蛋白质多样化的生理功能。DHHC(Asp-His-His-Cys)蛋白家族是一类与棕榈酰化修饰相关的蛋白,多数DHHC蛋白家族成员具有蛋白质酰基转移酶(protein S-acyltransferase,PAT)活性。该研究以鹅掌楸叶芽为材料,采用RT-PCR和RACE技术,克隆获得了3个鹅掌楸DHHC蛋白家族基因c DNA全长,命名为Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23。序列分析结果表明:Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23基因全长分别为1 933、2 592、2 217 bp,各包含1 332、1 839、1 662 bp的开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),编码433、612、533个氨基酸,预测蛋白分子量分别为40.04、67.3、60.57 k Da,理论等电点为9.15、9.03、7.29。3个基因编码的蛋白均有4个跨膜区,并且都在跨膜域(transmembrane domain,TM)TM2和TM3之间存在一个DHHC蛋白家族典型的DHHC-CRD结构域。同源性分析表明:鹅掌楸Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23编码的氨基酸序列与其他植物中预测的PAT具有较高的相似性。利用荧光定量PCR技术检测3个基因在鹅掌楸不同组织中的表达特性,发现3个基因在不同组织中均有表达,但表达量具有明显区别。同一家族基因表达模式的变化表明其功能非冗余。该研究结果将为鹅掌楸生长发育与形态建成,以及逆境响应信号传导等相关基因的调控研究提供了参考。
【作者单位】： 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室;
【关键词】： 鹅掌楸 棕榈酰化修饰 蛋白质酰基转移酶 DHHC蛋白家族 表达分析
【基金】：国家自然科学基金(31470660,31170621) 江苏省高校优势学科~~
【分类号】：Q943.2;S792.21
【正文快照】： 67.3 and 60.57 k Da,respectively.The predicted isoelectric points are 9.15,9.03 and 7.29,respectively.All the threeproteins contained four putative transmembrane(TM)domain structures,and contained a typically DHHC-CRD domainbetween TM2 and TM3 as most kn

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1 向静;拟南芥DHHC型锌指蛋白基因At5g04270分离鉴定与功能生化分析[D];湖南大学;2011年

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本文编号：806613