2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析

发布时间：2017-09-08 00:02

  本文关键词：2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析

  更多相关文章： 野扁桃 自交不亲和性 S-RNase基因 生物信息学 RACE

【摘要】：【目的】克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因SRNase全长序列,为自交不亲和性的分子调控奠定基础。【方法】以新疆野扁桃花柱为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆S-RNase基因全长,采用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、Prot Param、Tmpred、Signal P、Target P、SOPMA、DANMAN、MEGA6和Prot Fun对推导的氨基酸序列进行分析。【结果】克隆到Pt S16-RNase基因和Pt S17-RNase基因,2者均属于RNase T2基因家族,与其他多种植物的S-RNase基因的序列相似度为83%~98%,序列均具有S-RNas蛋白典型结构。Pt S16-RNase基因ORF长690 bp,编码229个氨基酸,Pt S17-RNase基因ORF长678 bp,编码225个氨基酸。预测2个S-RNase蛋白均为亲水性、不稳定的分泌蛋白,二级结构均以α-螺旋、延伸链和无规卷曲为主,在蔷薇科李属植物中具有较高的系统进化一致性,可能的主要功能为水解酶和激素。【结论】获得2个新疆野扁桃自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因S-RNase全长序列。
【作者单位】： 新疆农业大学农学院;新疆农业大学林学与园艺学院·新疆农业大学果树学新疆特色果树研究中心;中国林业科学院新疆分院;
【关键词】： 野扁桃 自交不亲和性 S-RNase基因 生物信息学 RACE
【基金】：国家自然科学基金(31260465) 国家林业公益性行业科研专项(201304701-1,201304701-5) 新疆维吾尔自治区科技计划项目(201130102-1-5) 新疆维吾尔自治区果树学重点学科(201007)
【分类号】：S662.9
【正文快照】： 2新疆农业大学农学院,乌鲁木齐830052;3中国林业科学院新疆分院,乌鲁木齐830000)and location of signal peptide cleavage sites of the deduced amino acid sequences were predicted by Sig-nal P 4.1 Server.The subcellular location of the deduced amino acid sequence

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 谭晓风;张琳;袁德义;曾艳玲;姜傲芳;;雪花梨S_(16)-RNase基因全长cDNA克隆及序列分析(英文)[J];浙江大学学报(农业与生命科学版);2008年02期

2 ;[J];;年期

中国重要会议论文全文数据库 前3条

1 BAI Cheng;LIU Liping;WOOD Bruce W.;;Nickel converts RNase A to a urease under presence of Nickel[A];2013全国植物生物学大会论文集[C];2013年

2 乌云塔娜;刘学英;;中国梨S-RNase基因启动子的TAIL-PCR克隆及功能预测[A];梨科研与生产进展（五）[C];2011年

3 杨芩;付燕;王永清;陶炼;邓群仙;范建新;邓仁菊;;枇杷6个品种S基因型鉴定及新S-RNase基因的克隆[A];第六届全国枇杷学术研讨会论文（摘要）集[C];2013年

中国博士学位论文全文数据库 前1条

1 袁晖;苹果花粉RING类E3泛素连接酶泛素标记S-RNase研究[D];中国农业大学;2014年

，

本文编号：810675