粗山羊草JAZ基因家族的全基因组鉴定与分析

发布时间：2017-09-08 05:09

  本文关键词：粗山羊草JAZ基因家族的全基因组鉴定与分析

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【摘要】：为了挖掘可用于小麦茉莉酸调控通路及其穗部或花器官发育研究的候选基因,基于已发布的粗山羊草全基因组数据,利用生物信息学分析方法鉴定了粗山羊草JAZ基因家族,并从染色体分布、基因及蛋白结构、启动子顺式作用元件、系统进化关系和基因表达模式等方面对该基因家族的特征进行了比较分析。结果表明,本研究共鉴定到9个粗山羊JAZ基因,命名为AetJAZ1-AetJAZ9。染色体定位结果显示,9个粗山羊草JAZ基因分别定位在2D、5D、6D和7D染色体上,其中在7D染色体上分布最多。进化分析表明,粗山羊草JAZ蛋白与短柄草JAZ蛋白亲缘关系最近,且9个粗山羊草JAZ蛋白被分别聚类到了S5、S12、S13、S16和S20五个亚族中,其中S20亚族有五个粗山羊草JAZ蛋白。启动子分析表明,9个粗山羊草JAZ基因启动子顺式作用元件种类和数量存在差异,推测其各自的功能也存在差异。表达谱分析表明,粗山羊草JAZ基因在粗山羊草不同组织间存在不同的表达特性,且不存在组成型表达基因,其中,AetJAZ1和AetJAZ2表现出明显的组织特异性,分别只在穗部、雌蕊和雄蕊中特异表达。
【作者单位】： 北京市农林科学院杂交小麦工程技术研究中心;杂交小麦分子遗传北京市重点实验室;首都师范大学生命科学学院;北京农学院植物科学技术学院;
【关键词】： 粗山羊草 JAZ 转录抑制因子 基因家族 花器官
【基金】：国家自然科学基金项目(31171172) 国家高技术研究与发展计划(863计划)项目(2011AA10A106) 北京市科技计划项目(Z141100002314018) 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140405;KJCX20140106) 北京市自然科学基金项目(5131001) 国家科技支撑计划项目(2013BAD04B01;2014BAD01B09) 北京市农林科学院国际合作项目(GJHZ2014-7;GJHZ2015-5)
【分类号】：S512.1
【正文快照】： JAZ(Jasmonate-ZIM-domain)基因编码SCFCOI1受体复合物的靶蛋白,是植物中特有的基因,仅见于苔藓植物、裸子植物和被子植物[1]。JAZ基因家族编码蛋白属于TIFY转录因子超家族,是植物中特有的一类转录因子,含有TIFY(又称ZIM)和Jas(又称CCT_2)功能结构域[2-3]。TIFY功能结构域位于

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前4条

1 何鑫;吴绍华;邓顺楠;陈月异;田维敏;;橡胶树HbJAZ3突变体蛋白的原核表达及纯化[J];热带作物学报;2013年10期

2 莫忠蓁;黄章科;周玉萍;黄小玲;田长恩;;拟南芥IQM1涉及主根生长对茉莉酸甲酯的反应[J];生物技术通讯;2015年03期

3 段龙飞;慕小倩;李文燕;;茉莉酸信号途径中转录抑制因子JAZ蛋白家族的分子进化分析[J];植物学报;2013年06期

4 敖涛;廖晓佳;徐伟;刘爱忠;;蓖麻GATA基因家族的鉴定和特征分析[J];植物分类与资源学报;2015年04期

中国博士学位论文全文数据库 前3条

1 于娟;拟南芥JAZ7基因参与黑暗诱导叶片衰老的分子机制研究以及玉米转录组学数据整合分析平台的初步构建[D];中国农业大学;2014年

2 白有煌;植物中编码基因TIFY家族和非编码基因IncRNA的生物信息学研究[D];浙江大学;2014年

3 李生平;水稻生长发育多效基因DDF1与锌指基因ZOS11-11的功能与表达分析[D];福建农林大学;2011年

中国硕士学位论文全文数据库 前7条

1 段龙飞;茉莉酸信号途径上关键基因家族COI/JAZ/MYC分子进化分析[D];西北农林科技大学;2013年

2 何鑫;巴西橡胶树JAZ和MYC家族几个成员基因表达和产量相关性的研究[D];海南大学;2013年

3 孙程;玉米TIFY家族ZmJAZ14基因的功能验证[D];中国农业科学院;2013年

4 周明;玉米TIFY/JAZ蛋白全基因组分析[D];四川农业大学;2013年

5 李肖琴;苹果醛脱氢酶（ALDH）和TIFY基因家族的鉴定、系统进化及表达分析[D];西北农林科技大学;2014年

6 李智奕;国内不同烟草品种的烟叶转录组分析[D];河南农业大学;2014年

7 高佳佳;巴西橡胶树几个与橡胶合成相关基因的物理定位研究[D];海南大学;2014年

【相似文献】

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1 ;艾美加推出新型外观设计的JAZ（r）2GB外接驱动器[N];大众科技报;2000年

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1 晋鑫鑫;SmJAZ3基因的克隆及JAZ调控丹参次生代谢的功能研究[D];陕西师范大学;2015年

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本文编号：812055