水稻Ra基因的分子标记开发及应用

发布时间：2017-09-08 23:39

  本文关键词：水稻Ra基因的分子标记开发及应用

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【摘要】：本研究通过对黑米(豫南黑籼糯)和紫叶白米(IR1552)Ra基因的测序,共找到了3个序列多态性位点。黑米的第10外显子存在2 bp缺失,紫叶白米的第2外显子(5'-UTR区)存在8 bp缺失,紫叶白米的第6内含子存在30 bp缺失。根据这3个多态性位点,分别设计了3对共显性分子标记Ra Marker1、Ra Marker2和Ra Marker3。将它们分别应用于黑米和白米重组自交系的筛选和验证,发现黑米的Ra基因型表现为Ra/Ra,白米的基因型表现为ra/ra,褐米的基因型表现为Ra/Ra或ra/ra。再加上该基因和黑米色素调控基因紧密连锁,因此这3个分子标记是黑色种皮的可靠标记,可进一步用于分子标记辅助育种的实践中。通过对Ra表达情况分析,发现该基因的2 bp缺失仅存在于黑米和褐米的c DNA中。通过实时定量PCR研究,发现该基因在黑米和褐米中存在一定的时空表达差异性。
【作者单位】： 中国水稻研究所;浙江大学农业与生物技术学院;浙江省微生物研究所;
【关键词】： 水稻 黑米 分子标记 基因连锁 时空表达
【基金】：国家自然科学基金(31500246) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2014RG006-1) 浙江省科技厅科研院所专项(2016F50015)共同资助
【分类号】：S511
【正文快照】： The Exploitation and Application of Molecular Markers of Ra In RiceShao Yafang1,3*Liu Chengzhi2Bao Jinsong31 China National Rice Research Institute,Hangzhou,310006;2 Zhejiang Institute of Microbiology,Hangzhou,310000;3 College of AgricultureBiotechnolog

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本文编号：817014