弧菌科质粒pJV的全序列测定、基因预测及其复制区的鉴定

发布时间：2017-09-09 14:28

  本文关键词：弧菌科质粒pJV的全序列测定、基因预测及其复制区的鉴定

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【摘要】：为了从条件致病菌鳗弧菌中提取到天然质粒,获得该质粒的全序列,并得到在弧菌中起复制作用的区域,试验采用向上引物和向下引物共9条,双向测通该质粒,经拼接得到质粒p JV的全序列,利用Glimmer3基因预测软件对该质粒可能包含基因模型进行预测和基因注释,通过在线工具OriFinder预测分析该质粒的复制区域,并将该区域克隆到T载体中,验证重组质粒在弧菌科菌种中的复制效果。结果表明:该质粒p JV全长5 982 bp(Gen Bank登录号为JQ782192),有4个含有核糖体结合位点的基因(UQY-2、UQY-3、UQY-4、UQY-6);质粒p JV的复制元件是一段长313 bp的序列(含Dna A boxes)。说明经过试验验证,该片段使T载体具有在维氏气单胞菌中复制的能力,即证明该片段为鳗弧菌质粒p JV的复制区,可用于新弧菌科载体的构建和疫苗研制等。
【作者单位】： 北京市水产科学研究所渔业生物技术北京市重点实验室;上海海洋大学;天津科技大学;
【关键词】： 鳗弧菌 质粒 测序 基因预测 复制区
【基金】：北京市自然科学基金项目(6152006) 北京市观赏鱼产业创新团队项目(BAIC03-2016)
【分类号】：S941.4
【正文快照】： 鳗弧菌(Vibrio anguillarum)是革兰氏阴性菌,属于弧菌科(Vibrionaceae veron),曾被分在弧菌属,但是据Gen Bank的专家意见和常见细菌系统鉴定手册[1],现被分类在利斯顿氏属(Listonella)。该菌广泛分布于海水和淡水中,是养殖及野生鱼类中常见的条件致病菌,可引起多种水产养殖动

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本文编号：820978