水曲柳FmGT8家族基因生物信息及表达模式分析

发布时间：2017-09-11 00:32

  本文关键词：水曲柳FmGT8家族基因生物信息及表达模式分析

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【摘要】：为研究水曲柳糖基转移酶8家族(glycosyltransferases,FmGT8)基因结构特征及编码蛋白性质,揭示其时空表达模式以及对应拉处理的响应机制,在获得4个水曲柳FmGT8基因的基础上,应用生物信息学软件对Fm GT8及其编码蛋白进行详细的分析;选择5—9月的水曲柳叶子、木质部以及外皮样本,利用实时荧光定量PCR分析FmGT8基因的表达模式;对水曲柳分别进行1、3、7 d的应拉处理,分析Fm GT8基因转录表达对应拉处理的响应模式。结果显示:获得了3个FmGT8全长基因(FmGT8-1,FmGT8-2,FmGT8-3)和1个Fm GT8基因片段(Fm GT8-4),已上传至NCBI并获得登录号分别为KP307672、KP307673、KP307674、KP307675。FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-3在木质部中表达量最高,Fm GT8-4在外皮中的表达量最高;FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-3均在6月的相对表达量达到最高,Fm GT8-4在9月表达量最高。4个基因在应拉处理材料中的表达模式各不相同,但均对应拉处理有响应。FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-4在应拉受力面的表达量最高,FmGT8-3在应压受力面表达量最高,说明FmGT8具有时空特异性。研究结果表明FmGT8家族基因可能参与了细胞壁与木质素的合成。
【作者单位】： 东北林业大学生命科学学院;
【关键词】： 水曲柳 FmGT 时空表达 应拉木 生物信息学
【基金】：“十二五”国家科技支撑计划(2012BAD21B0201-7) 国家重点实验室创新项目(2013B04)
【分类号】：S792.41
【正文快照】： 糖基转移酶(glycosyltransferases,GTs)是多糖合成中的关键酶[1],参与细胞壁组分(纤维素、半纤维素和果胶)的合成,催化多种分子的糖基化,参与植物发育、信号转导、防御等生物学过程[2-5]。根据序列同源性、特征结构域、疏水簇分析以及催化特异性等一系列特征,可将糖基转移酶分，

本文编号：827582