卵巢癌多药耐药相关基因的生物信息学分析

发布时间：2017-09-11 01:23

  本文关键词：卵巢癌多药耐药相关基因的生物信息学分析

  更多相关文章： 卵巢癌 多药耐药 基因 生物信息学分析 筛选与挖掘

【摘要】：目的筛选与挖掘卵巢癌多药耐药相关基因及其生物信息。方法基于GSE41499、GSE33482、GSE15372和GSE28739等4套来源不同的卵巢癌化疗耐药与敏感基因芯片表达谱数据集,综合运用差异基因表达分析、基因通路富集分析和文本挖掘等生物信息学方法预测卵巢癌多药耐药相关基因及通路。结果 MAPK信号通路、泛素介导的蛋白质水解、轴突导向、焦点粘连、神经营养素信号通路、癌症通路、肾细胞癌、柠檬酸循环、类萜骨干生物合成、错配修复和亨廷顿氏舞蹈病等11条基因通路是出现频率相对较高的显著性上调通路(P0.05),甘油脂、戊醣酸途径、果糖和甘露糖代谢、谷胱甘肽代谢、蛋白酶体、p53信号通路和溶酶体等7条基因通路是出现频率相对较高的显著性下调通路(P0.05);进一步的文本挖掘发现,ACO1、BDNF、CXCR4、HMGCR和NRP1等5个上调表达基因(P0.05)和CDKN2C、FAS和SKP2等3个下调表达基因(P0.05)可能与卵巢癌多药耐药形成相关。结论卵巢癌多药耐药机制的形成可能涉及到多种不同的通路和基因,其中ACO1、BDNF、CXCR4、HMGCR、NRP1、CDKN2C、FAS和SKP2等基因可能在其中发挥着关键作用,后续研究将对其进行实验和临床双重验证。
【作者单位】： 广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科;广西医科大学医学实验中心生物信息学教研室;
【关键词】： 卵巢癌 多药耐药 基因 生物信息学分析 筛选与挖掘
【基金】：国家高技术研究发展计划(863计划)(2012AA02A507) 广西自然科学基金(桂财教2014-118号) 广西科学研究与技术开发计划课题(桂科攻14124004-1-24)
【分类号】：R737.31
【正文快照】： 多药耐药形成相关。结论卵巢癌多药耐药机制的形成可能涉及到多种不同的通路和基因,其中ACO1、BDNF、CXCR4、HMGCR、NRP1、CDKN2C、FAS和SKP2等基因可能在其中发挥着关键作用,后续研究将对其进行实验和临床双重验证。0引言化疗是卵巢癌重要的治疗手段。尽管卵巢癌患者对化疗的

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 谭从娥;王米渠;冯文哲;徐全壹;;生物信息学分析寒证海量数据的探索[J];中华中医药学刊;2008年12期

2 程勇前;成军;刘妍;王琳;徐东平;钟彦伟;曲建慧;赵平;;钙离子调节亲环素配体及其不同剪接体的克隆及生物信息学分析[J];医学研究生学报;2008年05期

3 杨向东,王仁,刘俊文,唐蔚青,李红霞,王抒;一个新的人突触相关蛋白基因的生物信息学分析[J];中国动脉硬化杂志;2004年01期

4 张艳宇,马平,陆一鸣,吕丽萍,姜升阳,周锡鹏,孙树汉,许金波;尖吻蝮蛇类凝血酶基因的克隆及生物信息学分析[J];中国实验血液学杂志;2005年04期

5 张孝勇;崔光彬;杜滂;马克军;王亚蓉;韩苇;颜真;张英起;魏经国;;兔大电导钙敏感性钾离子通道β亚基的克隆及生物信息学分析[J];第四军医大学学报;2007年09期

6 蔡群芳;邬强;闫玉兰;吕刚;;欧猥迭宫绦虫谷胱甘肽转移酶1基因序列与功能的生物信息学分析[J];海南医学院学报;2013年05期

7 魏锁成;巩转娣;韦敏;;雄兔垂体GnRHR的序列测定与生物信息学分析[J];中国实验动物学报;2011年01期

8 尹积荣;杨凯;白玉兴;王邦康;;牙齿发育相关基因Osr2的生物信息学分析[J];现代生物医学进展;2011年14期

9 周金华;朱涛;李红雨;徐钢;王世宣;周剑锋;卢运萍;马丁;;基于WEB页面的生物信息学分析平台的构建及其应用[J];中国现代医学杂志;2006年17期

10 佘高明;聂Pr;张同园;李聪;刘炜;阮绪芝;;新基因FAM92A1的生物信息学分析及功能预测[J];郧阳医学院学报;2008年04期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 焦斐;阎萍;梁春年;郭宪;包鹏甲;裴杰;丁学智;褚敏;吴晓云;刘建;;牛FAS基因的生物信息学分析[A];中国畜牧兽医学会养牛学分会2011年学术研讨会论文集[C];2011年

2 唐爱发;余振东;桂耀庭;郭新;李贤新;周锦堂;朱辉;蔡志明;;SPACA4基因在人和小鼠的表达及其生物信息学分析[A];遗传学进步与人口健康高峰论坛论文集[C];2007年

3 刘惠君;谭宇蓉;刘持;向阳;屈飞;秦晓群;;BRS-3相互作用新基因的生物信息学分析及功能研究[A];湖南省生理科学会2008年度学术年会论文摘要汇编[C];2008年

4 黄浩;陆启轩;陈临溪;杨莉;毛小环;李兰芳;秦旭平;曹建刚;;APJ受体的生物信息学分析[A];全国第十二届生化与分子药理学学术会议论文集[C];2011年

5 陈大清;吴功庆;李亚男;;淹水胁迫下薏苡根系adh基因的克隆及其生物信息学分析[A];2005'海峡两岸植物生理与分子生物学教学研讨会论文集[C];2005年

6 田琪琳;施定基;贾晓会;王晓燕;黄希文;何培民;;真核藻PEPC的生物信息学分析[A];中国藻类学会第八次会员代表大会暨第十六次学术讨论会论文摘要集[C];2011年

7 陈玲;朱玲玲;史春梅;季晨博;郭锡熔;;miR-146b靶基因预测和生物信息学分析[A];2012年江浙沪儿科学术年会暨浙江省医学会儿科学分会学术年会、儿内科疾病诊治新进展国家级学习班论文汇编[C];2012年

8 苑赞;赵锦;刘孟军;;枣花粉过敏原Zizj1基因的克隆与生物信息学分析[A];第八届全国干果生产、科研进展学术研讨会论文集[C];2013年

9 王玲;高莲;李健;赖松家;;牛FoxO3基因的cDNA克隆及生物信息学分析[A];第五届中国畜牧科技论坛论文集[C];2011年

10 李婷;张英杰;刘月琴;李雪梅;李兰会;;反刍动物INHA基因编码区生物信息学分析[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会2014年全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2014年

中国博士学位论文全文数据库 前5条

1 陈蕾;原始蛋白酶结构功能的生物信息学分析及化学基础[D];山东师范大学;2009年

2 苏志熙;几种哺乳动物表达序列标签（EST）生物信息学分析[D];浙江大学;2006年

3 赵佳媛;灵长类二氧化碳感知通路相关基因的进化及生物信息学分析[D];复旦大学;2010年

4 张晓娜;枳（Poncirus trifoliata）低温相关microRNAs鉴定及ptf-miR396b抗寒功能研究[D];华中农业大学;2015年

5 马永平;含质粒人两歧双歧杆菌的分离、质粒测序和生物信息学分析[D];重庆医科大学;2005年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 杨蓓;猪TTV1-ORF1和TTV2-ORF1基因的克隆、表达及生物信息学分析[D];石河子大学;2015年

2 孙萃萍;多房棘球绦虫HSP20蛋白的生物信息学分析、重组表达及泡球蚴的体外培养[D];兰州大学;2015年

3 郭磊磊;基于整合组学数据的胃癌生物信息学分析[D];郑州大学;2015年

4 张天海;果蝇miRNA-92a进化保守性及其靶基因功能的生物信息学分析[D];南京师范大学;2015年

5 张璐;苹果CAX基因家族生物信息学分析及sMdCAX1基因遗传转化的研究[D];南京农业大学;2014年

6 蒋圆圆;梭梭4个14-3-3蛋白基因的克隆及分析[D];新疆农业大学;2015年

7 杨朗;烟草碳酸酐酶基因的克隆及其生物信息学分析[D];四川农业大学;2015年

8 曹峰;小鼠胚胎干细胞核心转录因子调控网络的生物信息学分析[D];西北农林科技大学;2008年

9 王翊;CEM15基因的生物信息学分析[D];电子科技大学;2005年

10 王芳;一个家蝇未知功能基因的克隆及其生物信息学分析[D];华中农业大学;2011年

，

本文编号：827797