南京地区腹泻婴幼儿新型诺如病毒GII.17变异株的检出及基因分析

发布时间：2017-09-11 12:45

  本文关键词：南京地区腹泻婴幼儿新型诺如病毒GII.17变异株的检出及基因分析

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【摘要】：目的了解南京地区腹泻婴幼儿新型GII.17诺如病毒变异株的检出及其基因特征,为疾病预防控制及疫苗研制提供切实有力的科学依据。方法收集2015年1-6月南京市妇幼保健院疑似病毒性腹泻粪便标本178份,采用荧光定量PCR方法对标本进行诺如病毒检测并对阳性标本进行基因分析。结果 178份粪便标本中,检出GII型诺如病毒27份,阳性率为15.2%,未检测出GI型诺如病毒,对该地区诺如病毒阳性标本进行衣壳蛋白区测序,发现27份GII标本中14株为新型GII.17变异株,8株为GII.3型,5株为GII.4-Sydney型;对其中5株GII.17变异株进行完整的衣壳蛋白VP1测序,发现其VP1区部分氨基酸已经出现了突变,而有些氨基酸位点的突变是与病毒抗原性及人群易感性密切相关。结论新型GII.17诺如病毒变异株在南京地区患病毒性腹泻的婴幼儿中检出,且检出率高于其他诺如病毒株,表明其可能已成为本地区新的诺如病毒流行变异株,考虑到其已在国内引起暴发流行,提示该毒株将会是本地区在今后重点预防控制监测的诺如病毒株。
【作者单位】： 南京市妇幼保健院检验科;南京市疾病预防控制中心急传科;国家疾病预防控制中心病毒病所;江苏省疾病预防控制中心急传所;
【关键词】： 诺如病毒 变异株 GII.型 基因分析
【基金】：十二五科教兴卫工程基金资助项目(ZX201109) 江苏医学重点人才基金资助项目(RC2011084)
【分类号】：R725.1
【正文快照】： 诺如病毒(Norovirus,NoV)属于杯状病毒科诺如病毒属,是引起暴发性和散发性非细菌性胃肠炎的重要病原体,在全世界约有20%急性胃肠炎病例是由NoV引起[1]。NoV基因组长约7.5kb,由3个开放阅读框(open reading frames,ORFs)组成,ORF1编码6个非结构蛋白,其中包括RNA聚合酶(RNA depen

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本文编号：830832