基于生物信息学分析人类线粒体转录终止因子1基因启动子

发布时间：2017-09-12 00:07

  本文关键词：基于生物信息学分析人类线粒体转录终止因子1基因启动子

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【摘要】：目的线粒体转录终止因子1(mitchondrial transcription termination factor 1,MTERF1)编码蛋白质是调控线粒体基因表达和氧化磷酸化的重要因子。文中旨在分析人类MTERF1基因的转录调控序列、转录因子及其结合位点。方法采用进化足迹法,利用生物信息学在线软件对人类MTERF1基因5'端上游的启动子分布、Cp G岛、转录因子及其结合位点进行分析。结果人类MTERF1基因定位于7q21.2,基因全长7845 bp,含有4个外显子和3个内含子。基因上游5'端2500bp的核苷酸序列至少存在2个启动子,其中1878-2447 bp之间可能包含核心启动子。启动子区序列中存在1个长为812 bp的Cp G岛。人类和小鼠MTERF1同源基因存在26个共同的转录因子结合位点。结论生物信息学在线软件能预测人类MTERF1基因启动子和转录因子结合位点,提高了针对该基因启动子的研究效率。
【作者单位】： 大理大学基础医学院/云南省昆虫生物医药研发重点实验室;大理市第一人民医院呼吸内科;
【关键词】： 生物信息学 线粒体转录终止因子 启动子 Cp G岛 转录因子
【基金】：国家自然科学基金(81560458) 云南省教育厅科学研究基金(2014Z126) 大理大学博士科研启动基金(BSKY2012018);大理大学大学生创新创业计划项目(201402)
【分类号】：Q811.4;R3416
【正文快照】： 0引言线粒体转录终止因子蛋白家族(mitochondrialtranscription termination factor,MTERF)是一类核基因编码转运到线粒体,并与线粒体DNA(mitochon-drial DNA,mt DNA)特异性结合的单体蛋白,在线粒体复制、转录和翻译中发挥调控作用[1]。目前在脊椎动物中发现4个MTERF蛋白家族

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1 张翼;转录终止因子PDE191调控拟南芥rpoA基因的转录终止[D];上海师范大学;2013年

2 张晓雷;拟南芥mTERF蛋白PDE191功能的初步研究[D];上海师范大学;2011年

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本文编号：833865