基于16S rRNA和RubisCO基因对嗜酸硫杆菌的系统发育及多样性

发布时间：2017-09-12 10:33

  本文关键词：基于16S rRNA和RubisCO基因对嗜酸硫杆菌的系统发育及多样性

  更多相关文章： Acidithiobacillus spp. S rRNA基因 RubisCO基因 系统发育 遗传多样性

【摘要】：【目的】明确不同地理来源的Acidithiobacillus spp.种群是否表现出显著的地域性和异域物种形成;为了解微生物谱系地理、多样性维持机制和微生物分子地理学提供基础数据。【方法】采用16S r RNA基因、核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubis CO)功能基因序列同源性分析构建相应的系统发育树,分析Acidithiobacillus spp.种群的遗传多样性。【结果】从3个不同的地域分离到35株菌聚为5大类群,其中菌株YNTR4-15可能是铁氧化细菌(Leptspirillum ferrooxidans),菌株HBDY3-3被鉴定为另一铁氧化细菌(Leptospirillum ferrodiazotrophum);有4株可能是Acidithiobacillus ferrivorans;6株是Acidithiobacillus ferridurans,其余菌株均被鉴定为Acidithiobacilus ferrooxidan。对26株代表性菌株的Rubis CO I型cbb L基因和II型cbb M基因的分析,发现19株菌具有双拷贝cbb L基因,分别为cbb L1和cbb L2基因;7株菌只检测到了cbb L1。cbb L1和cbb L2基因都有3个序列型;而cbb M基因是单拷贝。Rubis CO基因的密码子偏爱性不强。【结论】分离自3个地域的菌株16S r RNA/Rubis CO基因存在序列差异,Acidithiobacillus spp.种群存在显著的遗传多样性。嗜酸硫杆菌分离菌株基于16S r RNA基因的系统发育树和Rubis CO基因的发育树不一致。
【作者单位】： 石河子大学食品学院;石河子大学生命科学学院;
【关键词】： Acidithiobacillus spp. S rRNA基因 RubisCO基因 系统发育 遗传多样性
【基金】：国家自然基金(31260001,C010101)~~
【分类号】：Q933
【正文快照】： 嗜酸硫杆菌(Acidithiobacillus)是一类极其重要的极端微生物,能在极酸(p H1-3)、高浓度重金属环境中生长繁殖[1]。硫杆菌属的细菌是革兰氏阴性,杆状,化能无机自养生物型,通过氧化亚铁、硫和部分硫化物获得能量[1 3],在地球表面的酸矿废水、酸性污泥等含硫环境中分布广泛。到

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本文编号：836710