药用野生稻叶中花色苷合成基因的序列特点与表达差异

发布时间：2017-09-14 23:07

  本文关键词：药用野生稻叶中花色苷合成基因的序列特点与表达差异

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【摘要】：为全面把握花色苷合成基因在非模式植物绿色组织中的构成和表达,本研究利用转录组重测序方法,对药用野生稻(Oryza officinalis)绿叶中出现的花色苷合成基因进行了分析,结果共鉴定出8个相关基因(CHS、CHI、F3H、F3′H、F3′5′H、DFR、ANS和UFGT),这些基因与栽培稻同源基因对之间在mRNA水平上的序列相似度达到了94%~96%。相对外类群的K_a/K_s(非同义替换率与同义替换率的比值)统计检验进一步表明这8个基因均处于严格的纯化选择之下。RPKM(每百万读段中每千个碱基长度的读段数)值分析表明,8个基因的表达水平不同,其中F3′5′H的相对表达量最高,CHI和CHS次之,F3′H最低。
【作者单位】： 曲阜师范大学生命科学学院;
【关键词】： 药用野生稻 叶转录组 花色苷合成途径 基因表达
【基金】：国家自然科学基金(31570218)~~
【分类号】：S511.9
【正文快照】： 收稿2016-05-10修定2016-07-21资助国家自然科学基金(31570218)。花色苷是一类水溶性植物色素,属于类黄酮(flavonoids)的一个亚类,是具有类黄酮典型结构——2-苯基苯丙吡喃阳离子结构的衍生物,具有C6-C3-C6碳骨架。花色苷广泛分布于植物的花、果实、茎、叶和根等器官中,是植物

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