大豆GmST1基因的生物信息学分析

发布时间：2017-09-17 07:04

  本文关键词：大豆GmST1基因的生物信息学分析

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【摘要】：磺基转移酶(sulfotransferase,SULT)基因是一个基因超家族。对大豆磺基转移酶基因GmST1(Glyma.13G191400)进行基于生物信息学的基因结构分析与功能预测,结果表明:GmST1(Williams82)基因序列全长1 439 bp,CDS区长1 035 bp,编码344个氨基酸。通过序列比对,分析出在感病Williams 82和抗病品种东农93-046中,GmST1序列存在着非同义SNP,导致氨基酸改变。利用Plant CARE分析启动子元件,发现在基因启动子序列中含有多个与光诱导、生长素、水杨酸、干旱等相关的元件。在BAR数据库中分析了GmST1的拟南芥同源基因在不同逆境胁迫条件下基因表达情况,表明该基因表达具有组织表达特异性,参与盐胁迫、干旱胁迫和抗病等相关反应。
【作者单位】： 东北农业大学农学院/大豆生物学教育部重点实验室/东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室;
【关键词】： 大豆 GmST 磺基转移酶 蛋白质结构分析 功能预测
【基金】：国家现代农业产业技术体系(CARS-04-PS04) 国家自然科学基金(31301339) 黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12541049) 黑龙江省普通高等学校新世纪优秀人才培养计划(1253-NCET-005)
【分类号】：S565.1
【正文快照】： SULT是一个基因超家族,家族成员包括酚磺基转移酶、雌激素磺基转移酶、羟基类固醇磺基转移酶以及脱水表雄甾酮磺基转移酶等[1-2]。它参与机体内的Ⅱ相代谢,催化多种内源性和外源性复合物进行硫酸化代谢,有解毒作用[3]。磺基转移酶在人类、动植物及微生物中均有发现[4]。其中,，

本文编号：867941