小麦UROS基因的可变剪接

发布时间：2017-09-19 18:21

  本文关键词：小麦UROS基因的可变剪接

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【摘要】：可变剪接是一种重要的基因表达调控机制,对植物的发育、生理、代谢、信号转导以及外界逆境的响应等多个过程都有调控。为进一步探讨小麦基因的可变剪接机制以及深入研究小麦UROS基因的功能,以返白系、矮变1号和中国春三个普通六倍体小麦品种为材料,克隆了尿卟啉原Ⅲ合成酶基因(UROS)的gDNA和cDNA序列,并利用生物信息学技术研究了小麦叶片中UROS基因的可变剪接方式。结果表明,根据在线小麦基因组数据库,将克隆到的UROS基因组DNA序列分别定位在4BL和4DL两个基因位点,命名为UROS-4B和UROS-4D。从三个品种中克隆得到大约50个不同的UROS基因cDNA序列,通过在线预测和与基因组序列比对,发现UROS基因存在可变剪接,并鉴定出两个UROS基因位点各有一个标准剪接转录本和两个非标准剪接转录本。可变剪接方式以内含子保留为主,还有可变的供体剪接位点和可变的受体剪接位点,品种间的剪接方式不完全相同。由不同转录本预测编码的多肽氨基酸序列也存在差异,两个基因位点选取的六个转录本所编码的多肽有12个氨基酸位点的变异。
【作者单位】： 西北农林科技大学生命科学学院;旱区作物逆境生物学研究国家重点实验室;
【关键词】： 小麦 返白系 尿卟啉原Ⅲ合成酶 可变剪接 标准剪接与非标准剪接
【基金】：国家自然科学基金项目(30971769,31371541)
【分类号】：S512.1
【正文快照】： rieties showed diverse splicing types.In addition,the predicated amino acid sequence of these tran-scripts were dissimilar,twelve variant amino acid sites were identified from six polypeptides encodedby six clones from different transcripts,respectively.

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本文编号：883197