猪抗酶1基因核心启动子区鉴定及单倍型转录活性比较
本文关键词:猪抗酶1基因核心启动子区鉴定及单倍型转录活性比较
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【摘要】:通过双荧光素酶报告基因载体系统检测猪抗酶1(AZ1)基因启动子转录活性,分析蓝塘和长白猪群体AZ1基因启动子SNP及单倍型,在此基础上比较不同单倍型转录活性。结果表明:-453/+79为核心启动子区;在2个群体中检测到AZ1基因启动子8个SNPs,分别为-713 TC、-584 AC、-476 GA、-365 TC、-348 CT、-294 GC、-288 TG和-234 TC,蓝塘猪群体具有更丰富的单核苷酸多态性,而长白猪群体仅在-288座位存在GG和GT 2种基因型,其他7个SNPs均为纯合状态;蓝塘猪群体LTH1单倍型(TAGCCGTC,-713/-234)频率为0.526,为蓝塘猪优势单倍型,其次为LTH2(TAGCCGTT),频率为0.166;长白猪群体优势单倍型为Landrace-H(TAGTCGGT),频率为0.939。LTH1转录活性高于LTH2和Landrace-H,推测-234 TC、-365 TC和-288 TG座位是造成不同单倍型转录活性差异的原因。
【作者单位】: 广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室/华南农业大学动物科学学院;广东第二师范学院生物与食品工程学院;
【关键词】: 猪 抗酶(AZ)基因 启动子 SNP 单倍型
【基金】:国家自然科学基金项目(31201771) 现代农业产业技术体系专项(CARS-36)
【分类号】:S828
【正文快照】: 多胺,包括腐胺、亚精胺、精胺等,是机体内广泛存在的一类脂肪族多价阳离子,对于基因表达、蛋白合成和细胞的程序性死亡具有重要的意义[1-2]。但是多胺的代谢异常能够损害细胞功能并引起死亡[3],如过低水平多胺导致细胞增殖停止[4],过高则由于多胺的毒性使细胞死亡[5],因此多胺
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,本文编号:884029
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