杜仲幼果和叶片MVA途径基因表达差异分析

发布时间：2017-09-20 13:29

  本文关键词：杜仲幼果和叶片MVA途径基因表达差异分析

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【摘要】：【目的】杜仲橡胶是一种多萜类物质,而甲羟戊酸(MVA)途径是合成萜类物质的重要途径之一。分析杜仲MVA途径相关基因表达的差异,预测杜仲橡胶合成的主要上游途径。【方法】在杜仲幼果和叶片转录组测序的基础上,根据基因功能注释和表达分析,确定MVA途径的系列基因,并对其进行表达差异分析。【结果】杜仲橡胶合成的MVA途径共涉及23条Unigene,分别为3条EuACOT、3条EuHMGS、8条EuHMGR、2条EuMK、1条EuPMK和6条EuMDP基因。根据转录组RPKM(Reads Per Kilo bases per Million reads)数据对基因表达差异进行分析,结果表明杜仲MVA途径中的EuACOT8、EuACOT10、EuHMGS4、EuHMGS5、EuHMGS6、EuHMGR18、EuMK3、EuMK4、EuMDP7、EuMDP8、EuMDP9、EuMDP10、EuMDP11基因在幼果和叶片中的表达量具有显著差异,其中仅EuMDP9在叶片中的表达量大于幼果,而其余基因在幼果的表达量大于叶片;EuHMGR15和EuHMGR17只在幼果中特异表达。【结论】MVA途径绝大部分基因在果实中大量表达,这与果实中杜仲橡胶含量远超过叶片的现象相吻合,推测杜仲果实MVA途径为杜仲橡胶合成的主要途径。
【作者单位】： 中国林业科学研究院经济林研究开发中心;国家林业局杜仲工程技术研究中心;国家林业局中南林业调查规划设计院;
【关键词】： 杜仲 幼果和叶片 甲羟酸途径 基因表达差异
【基金】：国家林业公益性行业科研专项(201004029)
【分类号】：S567.19
【正文快照】： 杜仲(Eucommia ulmoides Olives)是中国特有的名贵滋补药材,具有补肝肾、益筋骨、安胎等多种功效[1];除此之外,杜仲叶片、果实、树皮、根中均含有大量的天然胶状物质——杜仲橡胶(Eucommiaulmoides Rubber,EUR)。杜仲橡胶是温带地区重要的胶源,杜仲树在温带地区适生面积较广。

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1 王淋;乌云塔娜;刘慧敏;叶生晶;杜红岩;;杜仲MVA途径相关基因全长cDNA序列特征研究[J];中南林业科技大学学报;2014年01期

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1 张玉芬;补肾活血汤对绝经后MVA疗效观察及机制研究[D];第四军医大学;2013年

2 吴涛;在大肠杆菌内引入MVA途径高效合成抗疟药青蒿素前体—紫穗槐-4，11-二烯[D];福建师范大学;2011年

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4 湛倩倩;表达HIV-1 CRF01_AE gp145的DNA与MVA疫苗构建及免疫原性评价[D];北京工业大学;2015年

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本文编号：888345