微小RNA靶基因预测及功能分析方法综述

发布时间：2017-09-23 05:33

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【摘要】：miRNA主要的功能是与靶标miRNA的3′或5′非翻译区甚至CDS区进行不完全不精确的碱基配对,从而抑制信使RNA(miRNA)的翻译或降解miRNA。然而,目前对大多数mi RNA的调节机制及其结合的靶基因知之甚少。基于计算生物学的mi RNA靶基因预测提供了一种有效且经济的分析方法,对目前几个典型的mi RNA靶基因的生物信息学分析方法进行了系统阐述,详细论述了mi RNA靶基因的预测方法和靶基因下游的生物信息学分析,包括mi RNA差异筛选、靶基因预测、靶基因富集分析、mi RNA和靶基因相互作用网络的构建、mi RNA与通路的网络构建等,系统论述了mi RNA差异表达的分析方法和步骤,为实验验证结果提供了可靠的参考方法,为开展mi RNA的功能分析和实验研究提供借鉴。
【作者单位】： 广东医学院中美肿瘤研究所;北方民族大学生物科学与工程学院;天津师范大学生命科学学院;
【关键词】： miRNA 靶基因预测 功能分析
【基金】：宁夏高等学校科学研究资助项目(NGY20140155)
【分类号】：Q78
【正文快照】： 0引言微小RNA(mi RNA)是一类广泛存在于真核动、植物细胞中的一类平均长度约18~24 nt的内源性小分子非编码RNA,在物种进化中相当保守,其表达具有显著的组织和时序特异性。截止到2014年6月,Sanger数据库Version 19.0(http://www.mirbase.org/)公布的mi RNA数目达到了28 654个。

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本文编号：903496