宫颈鳞状细胞癌组织中miRNA差异性表达及其靶基因作为诊断标志物的意义

发布时间：2017-09-25 12:29

  本文关键词：宫颈鳞状细胞癌组织中miRNA差异性表达及其靶基因作为诊断标志物的意义

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【摘要】：目的:采用生物信息学方法研究宫颈鳞状细胞癌(CESC)组织中差异性表达的miRNA并预测其靶基因,以期找到影响CESC发生发展及可用于肿瘤标志物的miRNA。方法:癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载3例CESC组织及3例配对正常组织,用统计学方法对差异性表达的基因及miRNA进行筛选,通过靶基因预测网站对差异性表达的miRNA进行靶基因预测,运用KEGG数据库分析靶基因参与的肿瘤相关信号通路。结果:与同源正常组织比较,CESC组织有18个miRNA和1 180个基因有差异性表达(P0.05),其中有15个miRNA和411个基因上调,3个miRNA和770个基因下调,采用靶基因预测网站有7个miRNA与预测到的靶基因呈负向调控关系,6个上调miRNA的靶基因下调,1个下调miRNA的靶基因上调,靶基因集中在Wnt、MAPK、P53和cAMP等肿瘤相关信号通路。结论:差异性表达的miRNA包括hsa-miR-27a、hsa-miR-148b、hsa-miR-185、hsa-miR-200a、hsa-miR-200b、hsa-miR-221和hsa-mir-133b,差异性表达的miRNA及其靶基因在CESC的发生发展过程中起重要作用,有可能成为诊断CESC的肿瘤标志物。
【作者单位】： 吉林大学公共卫生学院卫生部放射生物学重点实验室;
【关键词】： 宫颈鳞状细胞癌 微小RNA 肿瘤标志物
【基金】：国家自然科学基金资助课题(31370837) 吉林省卫生计生委基金资助课题(20142036) 吉林省科技厅科研基金资助课题(201205010)
【分类号】：R737.33
【正文快照】： 生物信息学是将分子生物学与信息处理技术结合,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的交叉学科,其目的是利用各种数据库,分析整理其数据的意义而揭示大量复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。癌症基因组图谱(the cancergenome atlas,TCGA)数据库是由美国国家癌症研究

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本文编号：917403