沙棘WRI1转录因子基因的生物信息学分析

发布时间：2017-09-27 09:26

  本文关键词：沙棘WRI1转录因子基因的生物信息学分析

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【摘要】：以构建的沙棘(Hippophae rhamnoides Linn.)不同组织转录组数据库为基础,分离得到1个沙棘WRI1转录因子编码基因,命名为Hr WRI1,利用生物信息学方法对其基因结构、理化性质、保守域、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点和高级结构等进行了预测和较为全面的分析。结果表明,该成员含有1 206 bp的完整开放阅读框,编码401个氨基酸组成的不稳定亲水蛋白,无信号肽和跨膜结构域,存在多个磷酸化位点,定位于细胞核中,高级结构以无规则卷曲为主。与不同植物中已报道的同源WRI1转录因子进行多重序列比对后,发现它们在核酸与氨基酸水平均高度同源,并且具有相同的结构域。
【作者单位】： 大连民族大学环境与资源学院/资源植物研究所;
【关键词】： 沙棘(Hippophae rhamnoides Linn.) WRI基因 生物信息学
【基金】：国家自然科学基金项目(31570681)
【分类号】：S793.6;Q943.2
【正文快照】： 沙棘属(Hippophae)系林奈于1753年以沙棘(Hippophae rhamnoides Linn.)为模式建立的。沙棘又名醋柳、酸刺等,为胡颓子科沙棘属落叶灌木或小乔木,是一种新兴的小浆果类树种[1,2]。近年来,植物油脂的需求量越来越多,利用基因工程技术提高油料作物中植物油的含量已经成为最有发展

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1 吴晓梅;吴雄熊;陈明训;;拟南芥WRI1基因的克隆及其植物反义载体的构建[J];江苏农业科学;2010年03期

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本文编号：928897