玉米Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶基因家族生物信息学分析

发布时间：2017-09-29 03:02

  本文关键词：玉米Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶基因家族生物信息学分析

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【摘要】：Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase,P5CS)是脯氨酸代谢途径的关键酶,对植物抵抗逆境胁迫起至关重要的作用。为了探索P5CS在玉米对逆境胁迫的响应,本文对5个玉米P5CS基因家族蛋白的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、基因结构、进化关系及保守基序等方面进行初步生物信息分析。结果显示,5个玉米P5CS蛋白中有3个偏酸性,1个显中性,1个偏碱性;2个以无规则卷曲为主要构成元件,3个P5CS蛋白主要以α白螺旋为主要构成元件;不稳定指数分析发现,4个P5CS蛋白为稳定蛋白;疏水性分析表明,所有的P5CS蛋白为亲水性蛋白;玉米P5CS家族内含子最少含有4个内含子,最多的含有19个内含子;亚细胞定位分析表明,P5CS均蛋白定位于细胞基质;进化分析表明,P5CS家族分3个亚家族。
【作者单位】： 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室;
【关键词】： 玉米 Δ-吡咯啉--羧酸合成酶(PCS) 生物信息 基因家族
【基金】：中央级公益性科研院所基本科研业务专项(1630062014010,1630062015017,1630062015003) 海南省自然科学基金(20153134)
【分类号】：S513
【正文快照】： 脯氨酸作为植物体内一种重要的渗透调节物质,主要有渗透调节、保护生物大分子以及参与氮代谢和能量代谢等作用[1]。在植物体内,脯氨酸的合成是通过谷氨酸途径和鸟氨酸途径进行的[2]。逆境胁迫下,谷氨酸途径是合成脯氨酸的主要途径[3]。Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(Delta-1-pyrrol

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本文编号：939562