湖南洞庭湖区12株H9N2亚型AIV全基因序列的进化分析

发布时间：2017-10-01 11:14

  本文关键词：湖南洞庭湖区12株H9N2亚型AIV全基因序列的进化分析

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【摘要】：【目的】从分子生物学角度了解H9N2亚型禽流感病毒在湖南省洞庭湖区的变异特点和进化规律。【方法】对近年来洞庭湖区分离的12株H9N2亚型禽流感毒株的全基因进行分段克隆测序,应用Mega 5软件包对病毒基因进行多序列比对和进化树的绘制与分析。【结果】12株H9N2亚型禽流感毒株HA裂解位点均没有多个连续的碱性氨基酸插入,属于低致病性病毒。12株H9N2亚型禽流感病毒HA、NA基因进化比较同步,均处于DK/HK/Y280/97分支,而6个内部基因(M、PB2、PB1、PA、NA、NS)与高致病性禽流感H5亚型毒株呈现不同程度重组现象,且与H7N9亚型毒株基因的核苷酸同源性很高,很有可能为其提供内部基因。【结论】湖南省洞庭湖地区H9亚型禽流感病毒的遗传演化较为复杂,存在广泛的基因重组现象。
【作者单位】： 湖南省动物疫病预防控制中心;中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室/兽医生物技术国家重点实验室;
【关键词】： HN亚型禽流感 遗传进化 洞庭湖区 湖南省
【基金】：国家“973”计划项目(2011CB505001)
【分类号】：S852.65
【正文快照】： 农业部动物流感重点开放实验室/兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江哈尔滨150001)禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)为负链单股RNA病毒,由8个基因片段组成,按照片段长度由大到小依次为PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M、NS基因。AIV感染的宿主范围、组织亲嗜性、致病力与HA的

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本文编号：953136