2p15区域候选基因与中国汉族人群中强直性脊柱炎的关联性研究

发布时间：2017-10-02 01:13

  本文关键词：2p15区域候选基因与中国汉族人群中强直性脊柱炎的关联性研究

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【摘要】：目的:探索2p15区域是否存在基因区域的易感位点与中国汉族人群中强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)的易感性存在关联。方法:所有的AS患者都来自于安徽医科大学第一附属医院风湿免疫科的门诊病例,疾病的诊断由具有副主任医师职称的风湿科医生根据1984年修订的AS纽约标准进行诊断,对照来自于合肥市中心血站的健康献血者,对照组与病例组按照年龄、性别和民族进行频数匹配。本研究采取的是两阶段的病例对照研究,第一阶段,选取rs10865331位点上下游的17个基因,采用目的区域深度测序的方法在100个AS患者和100个相匹配的健康对照中对可能的易感位点进行筛选,由于本次研究的探索性质,我们事先规定此阶段P值小于0.2即认为存在统计学上的关联;第二阶段,对于初步筛选出的可疑阳性位点和rs10865331位点,采用SNP分型技术在620例AS患者和相匹配的620例健康对照中进行大样本验证,SNP分型方法采用的是改进的多重连接酶检测反应(i MLDR)技术。通过比较各位点在两组间的基因型、等位基因和各种遗传模型下的频率分布以及位点间单倍型分布情况的差异,来阐明2p15区域是否存在与AS易感性有关联的新的易感基因和位点;患者的临床特征选择功能指数(BASFI)和疾病活动指数(BASDAI)进行分析。结果:第一阶段纳入的100例AS患者和100例健康对照中,男性患者79人,女性患者21人,平均年龄为29.50±9.68岁,对照组中男性80人,女性20人,平均年龄为29.91±9.25岁,两组人群在性别构成比和年龄分布上不存在统计学差异(χ2=0.031,P=0.861;t=-0.306,P=0.760)。最终有12个SNP位点(USP34基因上的rs14170,rs11428092,rs10208769,rs21231111位点,FAM161A基因上的rs6545910,rs6748320,rs3736598位点,AHSA2基因上的rs777585,B3GNT2基因上的rs3811616,C2orf74基因上的rs1729674,COMMD1基因上的rs55785307和KIAA1841基因上的rs1177284)被认为可能与AS存在潜在相关性,并用于后续的验证性分析。在第二阶段的验证性研究中,共纳入患者620例,健康对照620例,患者中包含男性515人,女性105人,平均年龄为28.28±8.92岁,对照中包含男性512人,女性108人,平均年龄27.83±7.58岁,两组间性别和年龄分布没有统计学差异(χ2=0.051,P=0.821;t=0.957,P=0.339)。本阶段的验证性研究,包含第一阶段初步筛选出的12个可疑SNP位点和之前已经得到验证的阳性位点rs10865331,研究结果显示,5个SNP位点(USP34基因上的rs14170,rs11428092,rs10208769,rs2123111和C2orf74基因上的rs1729674)可能与AS存在相关性(P0.05),尽管在Bonferroni校正以后,上述统计关联消失。其中rs11428092和rs10208769位点只在男性中有意义。此外,rs1729674,rs14170,rs2123111和rs10208769四个位点显示有较强的连锁不平衡(D’0.90,r20.80)并纳入单倍型分析,结果显示单倍型TAGA在病例组和对照组之间的分布存在统计学差异(χ2=4.741,P=0.029,OR(95%CI)=0.832(0.705,0.982));同时,本次研究再一次证明了rs10865331位点与AS易感性之间的关联性(P=0.001,OR(95%CI)=1.303(1.111,1.526))。临床特征分析发现,13个SNP位点各自的基因型与BASFI及BASDAI均无统计学差异。结论:我们的研究第一次在中国汉族人群中发现USP34和C2orf74基因可能是AS在2p15区域新的易感基因;此外本次研究发现了一个新的单倍型TAGA,该单倍型在AS的发病中可能具有保护性作用,未来仍需要进一步的扩大样本和在不同种族中对该结果进行验证。
【关键词】：强直性脊柱炎 2p15 遗传易感性 多态性
【学位授予单位】：安徽医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R593.23
【目录】：

• 英文缩略词表6-8
• 中文摘要8-10
• 英文摘要10-13
• 1. 前言13-16
• 2. 材料与方法16-32
• 2.1 研究对象16
• 2.2 流行病学资料的收集16-18
• 2.3 血液标本的采集18
• 2.4 DNA提取18-20
• 2.5 目的区域测序20-24
• 2.6 基因分型24-31
• 2.7 质量控制31
• 2.8 统计分析31-32
• 3. 结果32-50
• 3.1 研究对象的一般特征分析32-33
• 3.2 疾病相关SNP位点筛选阶段33-34
• 3.3 大样本SNP分型验证阶段34-50
• 4. 讨论50-55
• 5. 结论55
• 6. 参考文献55-62
• 附录162-65
• 附录265-70
• 致谢70-71
• 综述71-83
• 参考文献77-83

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7 龚卫娟,范丽安;强直性脊柱炎发病的遗传因素研究进展[J];国外医学.遗传学分册;2001年01期

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5 本报记者 熊昌彪;治疗强直性脊柱炎要走出两个误区[N];中国医药报;2013年

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7 ;强直性脊柱炎及早治疗是关键[N];上海科技报;2002年

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本文编号：956716