基于转录组的葱蝇表皮蛋白基因家族的鉴定及在非滞育和冬滞育条件下的表达分析

发布时间：2017-10-02 23:43

  本文关键词：基于转录组的葱蝇表皮蛋白基因家族的鉴定及在非滞育和冬滞育条件下的表达分析

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【摘要】：【目的】昆虫表皮蛋白在昆虫的生长发育、抑制水分蒸发和抵御其他外界不良环境等方面起到重要的作用。通过转录组水平上葱蝇Delia antiqua表皮蛋白基因家族的鉴定及部分基因在非滞育和冬滞育条件下的表达规律分析,为进一步研究葱蝇表皮蛋白在滞育期的抗逆功能奠定基础。【方法】基于转录组数据,通过生物信息学方法对葱蝇表皮蛋白基因进行鉴定分析,系统进化和保守结构域分析并采用实时荧光定量PCR法比较分析了12个基因在葱蝇非滞育和冬滞育不同发育时期的表达变化。【结果】在葱蝇中鉴定出81个表皮蛋白基因,分别属于RR(71个基因)、CPAP(5个基因)和CPLC(5个基因)亚家族,其编码的蛋白质含有92~495个氨基酸,分子量约为8.692~52.2 k D,等电点为3.90~9.93。亚细胞定位预测结果显示67个全长表皮蛋白均为外分泌型。12个葱蝇表皮基因在非滞育和冬滞育过程中有明显不同的表达规律。【结论】葱蝇表皮蛋白基因RR-2型的保守基序中发生了基因突变,引起关键氨基酸的替换,这可能暗示它们在非滞育和滞育不同条件下,不同发育阶段中蛹皮结构重建和某些器官的发生方面发挥不同作用。该研究结果为进一步阐明葱蝇滞育蛹皮结构及抗逆功能的研究提供了重要理论基础。
【作者单位】： 重庆师范大学生命科学学院昆虫与分子生物学研究所;
【关键词】： 葱蝇 表皮蛋白 基因家族 滞育 生物信息学 表达分析
【基金】：“两江学者”计划专项经费 联合国IAEA项目(18268/R0) 国家自然科学基金项目(31372265)
【分类号】：S433
【正文快照】： 葱蝇Delia antiqua(双翅目:花蝇科)是广泛分布于北半球温带地区的重要地下害虫,对百合科蔬菜的产量影响很大(滕学强和何振昌,1989)。葱蝇的生活史要经历卵、幼虫、蛹和成虫4个发育时期,幼虫阶段经历3个龄期,分别为1龄幼虫、2龄幼虫和3龄幼虫(陈斌等,2010)。研究表明,葱蝇通过

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3 李秉，

本文编号：961860