甘蓝型油菜花叶性状的遗传及基因定位
本文关键词:甘蓝型油菜花叶性状的遗传及基因定位
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【摘要】:.花叶是油菜的一种叶片形态,可应用于杂种鉴别、纯度鉴定以及遗传学研究等。前人关于油菜花叶的遗传学研究表明:花叶受一至两对质量基因控制,遗传关系相对简单,但至今未见对该性状进行基因定位的研究报道。 本研究以4个甘蓝型油菜品种(系)配制的组合Ⅰ(No.2127-17/花叶恢)和组合Ⅱ(YZ001-6/G350)的P1、P2及其F1和F2共四个世代为材料,结合采用SSR与BSA方法,筛选与花叶主效基因紧密连锁的SSR标记,用于分析作图群体基因型并绘制遗传连锁图,实现花叶主效基因的初步定位。另外,比较了两个遗传图谱间SSR标记的共线性并对定位区域进行了生物信息分析。主要结果如下: 1.F1植株叶形表现为半花叶说明花叶是不完全显性性状。 2.遗传分析结果表明花叶性状受一对主效基因控制,将该基因命名为BnML (Mosaic-leaf in Brassica napus)。 3.组合Ⅰ花叶主效基因定位于分子标记BrGMS3707与SSR648之间,遗传图距分别为16.2cM和8.3cM;组合Ⅱ花叶主效基因定位于分子标记BrGMS4768和BrGMS4779之间,遗传图距分别为4cM和6cM。 4.利用BrGMS3705与SSR648在两个组合遗传图谱间的共线性,将花叶主效基因BnML定位于甘蓝型油菜A10染色体,即分子标记BrGMS4768和BrGMS4779之间10cM遗传图距范围内,为BnML基因的精细定位及克隆奠定了基础。 5.通过标记序列与白菜基因组序列的比较分析,进一步将定位区域缩小至白菜拼接序列上975kb的物理距离范围内。通过高度保守的蛋白质结构域搜索,在此区域预测到4条与拟南芥的叶形调控家族基因高度相关的候选序列,为后续研究提供了有益启示。
【关键词】:花叶 不完全显性 初步定位 BSA SSR 遗传连锁图
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:S565.4
【目录】:
- 摘要6-7
- ABSTRACT7-9
- 缩略词表9-10
- 1 文献综述10-25
- 1.1 研究油菜叶形的意义10-11
- 1.1.1 作为形态标记10
- 1.1.2 改良油菜株型10
- 1.1.3 选育观赏油菜10-11
- 1.2 油菜叶形的研究概况11
- 1.3 叶形相关功能基因研究11-19
- 1.3.1 茎顶端分生组织与叶片发育11-13
- 1.3.2 叶形发育相关调控基因家族13-16
- 1.3.3 叶形发育的计算模拟研究16-17
- 1.3.4 叶形发生的分子系统研究17-19
- 1.3.5 对油菜叶形研究的启示19
- 1.4 质量性状基因定位19-23
- 1.4.1 分子标记技术19-21
- 1.4.2 作图群体构建21-22
- 1.4.3 连锁图谱定位22-23
- 1.4.4 芸薹属植物间比较研究23
- 1.5 植物图位克隆技术的新发展23-25
- 1.5.1 图位克隆传统方案24
- 1.5.2 图位克隆新发展24-25
- 1.5.3 图位克隆应用前景25
- 2 本研究目的与意义25-26
- 3 甘蓝型油菜花叶性状的遗传及基因定位26-40
- 3.1 材料与方法26-29
- 3.1.1 亲本材料26
- 3.1.2 F2定位群体的构建26
- 3.1.3 花叶性状调查及遗传分析26-27
- 3.1.4 DNA提取及混合池构建27
- 3.1.5 SSR标记筛选及分析27-28
- 3.1.6 连锁作图方法28-29
- 3.1.7 生物信息分析方法29
- 3.2 结果与分析29-39
- 3.2.1 花叶性状表现及遗传29-30
- 3.2.2 多态性SSR标记30-31
- 3.2.3 花叶性状分子鉴定31-32
- 3.2.4 紧密连锁的分子标记32-34
- 3.2.5 遗传连锁图谱及定位34-35
- 3.2.6 定位区域的生物信息35-39
- 3.3 讨论39-40
- 3.3.1 花叶主效基因初步定位39
- 3.3.2 分子标记辅助选择39
- 3.3.3 生物信息预测39-40
- 参考文献40-47
- 致谢47-48
- 附录48-51
- 1. CTAB小样法提取DNA48
- 2. CTAB小样法试剂配制48-49
- 3. PAGE胶制备49-50
- 4. 电泳50
- 5. 显影50
- 6. 垂直胶(6%PAGE)检测试剂配制50-51
【参考文献】
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,本文编号:976492
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