水稻生物钟相关基因的表达特征鉴定及其功能预测分析

发布时间：2017-10-08 17:19

  本文关键词：水稻生物钟相关基因的表达特征鉴定及其功能预测分析

  更多相关文章： 水稻 生物钟 共表达分析 应激反应 代谢过程

【摘要】：水稻作为我国重要农作物,其营养生长和生殖发育过程都受到严格的生物钟的控制,因此,生物钟基因的表达变化也是决定水稻产量和种子质量的主要决定因素之一。为了更全面系统的了解生物钟基因在水稻生长和发育过程中的功能,本研究采用生物信息学共表达方法,筛选和鉴定水稻和拟南芥中生物钟基因,并对比分析了这些生物钟基因在单双子叶模式植物中的可能功能。从水稻表达谱公共数据库中筛选与生物钟基因表达密切相关732个基因,并对筛选出的水稻生物钟相关基因进行表达特性、节律性、生物功能预测及其与拟南芥的对比分析,结果表明水稻和拟南芥的生物钟基因可能都具有在生物钟核心振荡器部分功能相对保守的特点。功能预测分析也还表明水稻生物钟基因参与了8类生物学过程,尤其在应激反应和代谢过程的方面具有明显富集性,从而间接佐证了水稻对于外界环境的响应及其代谢过程具有严格时间调控的分子机理。
【作者单位】： 上海交通大学生命科学技术学院;
【关键词】： 水稻 生物钟 共表达分析 应激反应 代谢过程
【基金】：国家自然科学基金项目(31370026,31570312和31500297)资助
【分类号】：S511
【正文快照】： 生物钟,也称昼夜节律钟(circadian clock),是生物适应环境周期性变化的一种普遍存在的内在机制,从低等的细菌到真核的真菌、植物、动物以及人类都存在这种调控系统(Li et al.,2013;Reddy and Rey,2014;Dibner and Schibler,2015)。生物钟可以在分子、生化、细胞、生理及行为等

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 葛磊,谭克辉,种康,许智宏;水稻花发育基因调控的研究进展[J];科学通报;2001年09期

2 李斌;水稻基因上演“三国演义”[J];科技信息;2001年12期

3 ;国际水稻大会在京召开 江泽民出席开幕式并讲话[J];农业机械;2002年10期

4 庾晋;白杉;;水稻市场面临的四大困惑[J];农村科技开发;2002年12期

5 ;水稻基因组测序动态资讯[J];中国种业;2002年01期

6 ;水稻基因研究取得新成果[J];吉林水利;2002年06期

7 海燕;我国科学家率先绘制出水稻基因图谱[J];山东农业;2002年05期

8 胡咏武,谭军,钟兰;用生物信息技术初步分析杂交水稻的抗病基因[J];温州医学院学报;2002年05期

9 赵晓梅;我国科学家完成水稻基因 第四号染色体的精确测序[J];中国稻米;2003年01期

10 王子齐;全球水稻科学家的世纪盛会——北京国际水稻大会侧记[J];福建稻麦科技;2003年01期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 赵基洪;;水稻与菰属间性状转移研究[A];新世纪 新机遇 新挑战——知识创新和高新技术产业发展（下册）[C];2001年

2 张国良;陈文军;戴其根;许轲;霍中洋;张洪程;;水稻耐1，2，4-三氯苯胁迫基因型的筛选[A];中国作物学会栽培专业委员会换届暨学术研讨会论文集[C];2007年

3 裴忠有;;水稻T—DNA插入群体的建立及突变体筛选[A];2008中国作物学会学术年会论文摘要集[C];2008年

4 张桂权;丁效华;曾瑞珍;张泽民;李文涛;陈兆贵;刘冠明;何风华;AkshayTulukdar;刘芳;席章营;黄朝锋;朱文银;易懋升;秦利军;施军琼;赵芳明;冯明姬;单泽林;陈岚;郭晓琴;JaiChandRana;;水稻功能基因组学材料平台的建立[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年

5 王景余;孙海波;李艳萍;邹美智;;水稻遗传转化研究及应用进展[A];中国农业生物技术学会第三届会员代表大会暨学术交流会论文摘要集[C];2006年

6 姬生栋;秦广雍;耿飒;盛有名;薛华政;吴刘成;徐存拴;霍裕平;;离子束介导玉米基因组DNA的水稻后代遗传性状研究[A];全国作物生物技术与诱变技术学术研讨会论文摘要集[C];2005年

7 李阳生;朱英国;;水稻设计育种[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年

8 罗彦长;王守海;;分子标记辅助水稻抗病虫育种进展[A];现代农业理论与实践——安徽现代农业博士科技论坛论文集[C];2007年

9 沈辉;王宗阳;;水稻OsEBP89基因启动子的功能分析[A];中国植物生理学会全国学术年会暨成立40周年庆祝大会学术论文摘要汇编[C];2003年

10 陈石燕;王宗阳;;T-DNA介导的promoter trap系统[A];中国植物生理学会第九次全国会议论文摘要汇编[C];2004年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 ;日本破译3.2万个水稻基因[N];今日信息报;2003年

2 田耕;水稻基因组图谱带来希望与困惑[N];大众科技报;2002年

3 本报记者 徐玲玲;杨焕明：评说水稻“基因大战”[N];科技日报;2001年

4 本报驻美国记者 王如君;水稻基因研究里程碑（科技大观）[N];人民日报;2002年

5 杨健、蒋建科;水稻基因“天书”被打开[N];人民日报;2005年

6 通讯员 娄沂春 记者 马瑛瑛;浙大成功开发大容量水稻基因芯片[N];浙江日报;2001年

7 记者　韩晓玲、通讯员　王景刚;水稻基因研究获突破性进展 将全面提升我国水稻国际竞争力[N];湖北日报;2006年

8 邓肯;永久保护世界水稻资源协议签订[N];科技日报;2007年

9 徐瑞哲;沪苏皖育出“软糯”水稻新品种[N];农民日报;2006年

10 刘新萍;高个水稻具有玉米特性[N];江苏科技报;2007年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 张韬;水稻GAGA Element的预测与分析[D];电子科技大学;2008年

2 李冠义;两种水稻病毒胁迫下水稻的生物信息学研究[D];福建农林大学;2009年

3 倪建平;我国水稻知识产权现状与发展方向研究[D];中国农业科学院;2010年

4 陈裕坤;苯丙氨酸解氨酶基因遗传转化水稻的研究[D];福建农林大学;2011年

5 胡国成;适合于水稻的激发标签载体的优化和水稻激发标签突变体库的构建[D];浙江大学;2002年

6 梁淑家;水稻正向控制系统获得抗性的调节基因的功能鉴定[D];广西大学;2002年

7 全东兴;吉林省主栽水稻品种组织培养体系的优化及抗除草剂基因转化研究[D];东北农业大学;2002年

8 谢建平;湖北省水稻新品种选育与应用现状分析[D];华中农业大学;2004年

9 丁建;水稻突变体库的构建和旁邻序列分析[D];四川农业大学;2003年

10 张晶;几丁质酶基因及核糖体失活蛋白基因对水稻的遗传转化[D];东北农业大学;2003年

，

本文编号：995307