核盘菌磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶编码基因的预测与生物信息学分析

发布时间：2017-11-03 02:23

  本文关键词：核盘菌磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶编码基因的预测与生物信息学分析

  更多相关文章： 核盘菌 磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶 生物信息学

【摘要】：为了解磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶(PPTases)在核盘菌生理代谢与致病过程中的作用,在核盘菌全基因组中寻找PPTases同源物。利用同源比对的方法,预测出核盘菌中PPTases基因,进而分析其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、二级、三级结构和保守结构域,并对PPTases编码氨基酸进行遗传进化分析。结果表明,在核盘菌全基因组中预测存在3个PPTases基因同源物,分别命名为:Ss-Ppt1、Ss-Ppt2和Ss-Ppt3。3个蛋白均为亲水性的非分泌型蛋白,在其二级和三级结构中α螺旋结构和无规则卷曲占主要部分,且三者都含有PPTases的保守结构域SCOP和(或)ACPS。
【作者单位】： 安徽农业大学植物保护学院;宿州学院生物与食品工程学院;
【关键词】： 核盘菌 磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶 生物信息学
【基金】：国家公益性行业(农业)科研专项(201103016) 安徽省现代产业(油菜)体系专项 2014年宿州区域发展协同创新中心全国开放课题(2014SZXTKF04ZD)共同资助
【分类号】：S432.4;Q811.4
【正文快照】： 核盘菌[Sclerotinia sclerotiorum(Lib.)de Bary],是属于子囊菌门、柔膜菌目、核盘菌科、核盘菌属的植物病原真菌,可以侵染400种以上的植物,使多种重要的农作物产生重大经济损失[1]。充分认识核盘菌的生理代谢及其致病机制是防控核盘菌的基础。磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶(phosp

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 李秀丽;高智谋;;核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)致病分子机理研究进展[J];安徽农业大学学报;2013年02期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前5条

1 李秀丽;樊淼;吴亚;张茜茹;高智谋;;核盘菌磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶编码基因的预测与生物信息学分析[J];安徽农业大学学报;2016年03期

2 马立功;孟庆林;张匀华;刘志华;王志英;;向日葵谷胱甘肽-S-转移酶基因的克隆及抗病功能研究[J];中国油料作物学报;2015年05期

3 曹慧慧;黄军艳;柯涛;于景印;董彩华;刘胜毅;;萝卜抗菌肽基因Rs对菌核病的抗性[J];中国油料作物学报;2015年05期

4 贾芬;朱婷;赵小虎;生云鹏;明佳佳;贾玮;刘苑坤;;硒对油菜菌核病菌的抑制作用[J];中国农学通报;2015年25期

5 卜浩宇;李晓娟;东宝柱;周洪友;景岚;赵君;;冬季灌水对土壤中向日葵菌核的活力及其致病力的影响[J];植物保护学报;2014年03期

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 部建雯;姚广;高辉远;贾裕娇;张立涛;程丹丹;王鑫;;核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary)侵染抑制黄瓜光合作用的机理[J];植物病理学报;2009年06期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 刘万仁;王崇仁;吴友三;;核盘菌可溶性蛋白质及同工酶电泳研究[J];真菌学报;1989年01期

2 ;[J];;年期

中国重要会议论文全文数据库 前1条

1 陈景源;李桂华;刘金亮;张祥辉;陈婷婷;孙庚;潘洪玉;;核盘菌SsADA-1基因克隆、序列分析及其敲除载体的构建[A];中国植物病理学会2012年学术年会论文集[C];2012年

中国博士学位论文全文数据库 前5条

1 王爱荣;核盘菌与拟南芥互作的分子机制研究[D];福建农林大学;2006年

2 张军政;黑龙江省大豆核盘菌生物学特性和生物防治的研究[D];哈尔滨工业大学;2009年

3 戴富明;拟南芥与核盘菌互作及与核盘菌、水稻白叶枯病菌相关的拟南芥突变体筛选[D];浙江大学;2006年

4 贾娇;拟南芥转录因子MYB73抗核盘菌的分子机制研究[D];河北农业大学;2012年

5 穆文辉;转录因子Ss-Nsd1和Ss-Fox1调控核盘菌有性及无性发育的功能研究[D];吉林大学;2013年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 蔡婷;核盘菌弱毒菌株8-2-3中病毒分子特性及其对寄主生物学特性的影响[D];华中农业大学;2015年

2 葛常艳;核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)效应调控因子RRG-1和RRG-2的生物学功能研究[D];南京农业大学;2014年

3 游琴;四川三个地区油菜核盘菌遗传分化情况研究[D];四川农业大学;2015年

4 杨雷;利用绿色荧光蛋白基因标记核盘菌菌丝[D];哈尔滨工业大学;2006年

5 黄娟;核盘菌致病机制的关键因子分析[D];华中农业大学;2006年

6 李沛利;四川省核盘菌种群结构研究[D];四川农业大学;2006年

7 黄梦颖;拟南芥与核盘菌互作中调控细胞氧化还原状态的基因的鉴定与功能分析[D];福建农林大学;2014年

8 张重梅;大量产小孢子核盘菌菌株生物学特性及其小孢子萌发特性研究[D];华中农业大学;2011年

9 郭艳梅;核盘菌EST序列分析及农杆菌介导的遗传转化体系的优化[D];吉林大学;2008年

10 王雪亮;核盘菌转录因子SsMADS1的表达及其互作蛋白筛选的研究[D];吉林大学;2015年

，

本文编号：1134242