粘绿木霉Gv29-8的碳水化合物活性酶类蛋白预测及遗传关系分析

发布时间：2018-06-21 22:19

  本文选题：碳水化合物活性酶类蛋白 + 粘绿木霉　； 参考：《华中农业大学学报》2017年05期

【摘要】：利用CAT(CAZymes analysis toolkit)在线分析程序对Trichoderma virens Gv29-8中碳水化合物活性酶类蛋白(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)不同亚家族的分布情况进行分析,结果表明:粘绿木霉Gv29-8中含有185个CAZymes蛋白,分为主要类别和复合类别两种类型;其中,主要类别含有71个GH蛋白、54个CBM蛋白及12个AA蛋白、25个CE蛋白、3个PL蛋白、3个GT蛋白;复合类型含有17个蛋白。遗传关系分析表明,CAZymes分类应进一步细化到更小的类别。
[Abstract]:The distribution of carbohydrate active enzyme proteins in Trichoderma virens Gv29-8 was analyzed by cat (CAZymes analysis toolkit). The results showed that there were 185 CAZymes proteins in Trichoderma virens Gv29-8. There are 71 GH protein, 54 CBM protein and 12 AA protein, 25 CE protein, 3 PL protein and 3 GT protein in the main category and 17 protein in the complex type. The main category contains 71 GH protein, 54 CBM protein, 12 AA protein, 25 CE protein, 3 PL protein and 3 GT protein. Genetic analysis showed that the classification of CAZymes should be further refined to a smaller category.
【作者单位】： 西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金项目(31560211) 云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目(ZK150004) 云南省林学一流学科建设项目(51600625)
【分类号】：S476.1

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本文编号：2050252