不同连作年限草莓根际细菌和真菌多样性变化

发布时间：2018-07-04 10:38

本文选题：草莓 + 根际土壤　；参考：《微生物学通报》2017年06期

【摘要】：【目的】以不同连作年限草莓根际土壤为材料,探讨不同连作年限土壤细菌、真菌多样性的变化,以期为草莓连作障碍调控提供理论依据。【方法】将没有连作(CK)、连作1年(1Y)、连作8年(8Y)的土壤分别与珍珠岩以3:1的体积充分混匀装盆,"宁玉"草莓苗于2016年9月10日定植于盆栽土壤中,定植后50 d时(开花前)进行土壤取样,提取基因组DNA,通过PCR扩增建立文库,利用Mi Seq平台Illumina第二代高通量测序技术并结合相关生物信息学方法,分析土壤细菌16S rRNA基因V4+V5区域和真菌ITS1+ITS2区域的丰富度和多样性指数以及群落结构。【结果】从9个草莓根际土壤样本中获得3 192个细菌分类操作单元OTU和762个真菌OTU,其中,变形菌门、厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门和蓝藻门为草莓根际土壤的优势菌种,在CK、1Y、8Y草莓根际土壤中分别占细菌总数的87.86%、64.83%和61.79%;子囊菌门和担子菌门为优势真菌,在CK、1Y、8Y草莓根际土壤中分别占真菌群落的69.17%、69.06%和76.18%。从门的分类水平看,酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、绿弯菌门、蓝菌门、浮霉菌门、芽单胞菌门、变形菌门以及真菌担子菌门、接合菌门、壶菌门的比例在不同连作年限的草莓根际土壤中显著改变(P0.05)。属水平的分析也表明,共有29个细菌属和19个真菌属的比例发生改变(P0.05)。【结论】随连作年限的延长,草莓根际土壤生态系统中细菌和真菌群落各门类组成的比例会发生显著变化。
[Abstract]:In order to provide a theoretical basis for the regulation and regulation of strawberry continuous cropping obstacles , the soil samples were sampled and extracted by PCR . The richness and diversity index and community structure of soil bacteria 16S rRNA gene V4 + V5 region and fungus ITS1 + ITS2 region were analyzed by using the second generation high - throughput sequencing technology of Mi Seq platform Illumina . The results showed that there were 3,192 bacteria classified operating units OTU and 762 fungi OTU from 9 strawberry rhizosphere soil samples . Among them , the dominant species of rhizosphere soil of strawberry were tested .
【作者单位】：安徽大学资源与环境工程学院;江苏省农业科学院园艺研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室;
【基金】：江苏省现代农业研究开发示范类项目(No.BE2016369)~~
【分类号】：S154.3;S668.4

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