贝莱斯芽胞杆菌3A3-15菌株对盆栽大豆土壤细菌群落结构的影响
发布时间:2021-02-24 12:44
根腐病(root rot)是导致大豆(Glycine max)减产的主要病害,前期工作中筛选到1株对大豆根腐病病原菌—尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)具有较强拮抗作用的贝莱斯芽胞杆菌(Bacillus velezensis) 3A3-15菌株。为探究生防菌贝莱斯芽胞杆菌3A3-15对盆栽大豆根际土壤细菌群落结构的影响,将含有尖孢镰刀菌的盆栽分为2组,其中使用生防菌3A3-15菌株为处理组,不使用生防菌为对照组。采用高通量测序技术分析根际土壤细菌群落结构,利用usearch61聚类方法对分组后的操作分类单元(operational taxonomic units, OTU)进行分类学注释。Alpha多样性分析结果表明,处理组Shannon指数、谱系多样性(phylogenetic diversity, PD)值、Simpson指数和Chao1指数降低,但无显著差异。处理组特有2 258个OTU,较对照组(3357个)减少32.74%。前10位优势菌门分别是变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、芽单胞菌门、拟杆菌门、绿弯菌门、疣微菌门、浮鰴菌门、TM7和硝化螺旋菌门。处理组和对照...
【文章来源】:农业生物技术学报. 2020,28(05)北大核心
【文章页数】:8 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 菌株及主要试剂
1.2 菌液制备
1.3 盆栽处理
1.4 样品总DNA提取及检测
1.5 16S rRNA基因的PCR扩增
1.6 数据分析
2 结果与分析
2.1 16S rRNA基因的PCR扩增
2.2 测序数据和聚类分析
2.3 细菌Alpha多样性分析
2.3.1 Alpha多样性指数分析
2.3.2 测序深度分析
2.4 OTU特异性分析
2.5 细菌群落结构分析
2.5.1 门水平的群落结构分析
2.5.2 属水平的群落结构差异
2.6 Beta多样性分析
3 讨论
4 结论
【参考文献】:
期刊论文
[1]大豆不同生育期根际土壤细菌群落结构的变化[J]. 刘欣,李志英,刘瑞瑞,李璐璐,王卫卫. 广西植物. 2018(10)
[2]连作对大豆根际土壤细菌菌群结构的影响[J]. 殷继忠,李亮,接伟光,蔡柏岩. 生物技术通报. 2018(01)
[3]黄瓜枯萎病生物防治作用机理初步研究以及研究进展[J]. 刘艳,王振军. 农业科技通讯. 2016(10)
[4]解淀粉芽胞杆菌NCPSJ7对采后苹果轮纹病的生物防治作用[J]. 黄玲玲,裘纪莹,唐琳,陈相艳,刘孝永,周庆新,王永慧,陈蕾蕾. 中国食物与营养. 2015(02)
[5]兰花枯萎病拮抗细菌的筛选与鉴定[J]. 连彩,郭晓军,朱宝成,王建明,张超,曹晓璐,姚娜. 华北农学报. 2012(02)
[6]基于营养竞争原理的大豆根腐病生防芽孢杆菌的筛选及其特性研究[J]. 郭荣君,李世东,张晶,张旋,穆光远,王忠玉. 植物病理学报. 2010(03)
本文编号:3049390
【文章来源】:农业生物技术学报. 2020,28(05)北大核心
【文章页数】:8 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 菌株及主要试剂
1.2 菌液制备
1.3 盆栽处理
1.4 样品总DNA提取及检测
1.5 16S rRNA基因的PCR扩增
1.6 数据分析
2 结果与分析
2.1 16S rRNA基因的PCR扩增
2.2 测序数据和聚类分析
2.3 细菌Alpha多样性分析
2.3.1 Alpha多样性指数分析
2.3.2 测序深度分析
2.4 OTU特异性分析
2.5 细菌群落结构分析
2.5.1 门水平的群落结构分析
2.5.2 属水平的群落结构差异
2.6 Beta多样性分析
3 讨论
4 结论
【参考文献】:
期刊论文
[1]大豆不同生育期根际土壤细菌群落结构的变化[J]. 刘欣,李志英,刘瑞瑞,李璐璐,王卫卫. 广西植物. 2018(10)
[2]连作对大豆根际土壤细菌菌群结构的影响[J]. 殷继忠,李亮,接伟光,蔡柏岩. 生物技术通报. 2018(01)
[3]黄瓜枯萎病生物防治作用机理初步研究以及研究进展[J]. 刘艳,王振军. 农业科技通讯. 2016(10)
[4]解淀粉芽胞杆菌NCPSJ7对采后苹果轮纹病的生物防治作用[J]. 黄玲玲,裘纪莹,唐琳,陈相艳,刘孝永,周庆新,王永慧,陈蕾蕾. 中国食物与营养. 2015(02)
[5]兰花枯萎病拮抗细菌的筛选与鉴定[J]. 连彩,郭晓军,朱宝成,王建明,张超,曹晓璐,姚娜. 华北农学报. 2012(02)
[6]基于营养竞争原理的大豆根腐病生防芽孢杆菌的筛选及其特性研究[J]. 郭荣君,李世东,张晶,张旋,穆光远,王忠玉. 植物病理学报. 2010(03)
本文编号:3049390
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