黑龙江玉米农田氨氧化微生物丰度及分布研究
发布时间:2021-03-17 23:33
氨氧化过程是硝化过程中的限速步骤,在氮循环中起着至关重要的作用。氨氧化古菌(ammonia oxidizing archaea, AOA)的发现让人们认识到氨氧化细菌(ammonia oxidizing bacteria, AOB)并不是唯一在氨氧化过程中起作用的微生物。厌氧氨氧化菌(anearobic ammonia oxidizing bacteria, anammox bacteria)能够在缺氧或者厌氧的条件下将氨氮和亚硝酸盐直接转化成N2,而且有文献报道这类微生物在土壤环境中也是普遍存在。本课题利用克隆基因文库、荧光定量等分子生物学技术,对黑龙江玉米农田土壤中AOA、AOB、Anammox菌群落多样性、系统发育和丰度等进行了研究,并探索了AOA、AOB的amoA基因数量和环境因素之间的关系。本次试验选取的样品来自于黑龙江省农科院某玉米试验农田土壤。本次试验针对7个不同的氮肥施加(0-250%优化施肥量)玉米地试验田的三个不同时期(5月播种期、7月生长期、10月收割期)进行研究。通过荧光定量分析(RT-PCR)结果可知,各个时期、各个氮肥处理间AOA的amoA基因数量差异并不大...
【文章来源】:大连理工大学辽宁省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
引言
1 文献综述
1.1 土壤氮素循环综述
1.1.1 氮的存在形式
1.1.2 土壤氮素循环
1.2 氨氧化细菌概述
1.2.1 氨氧化细菌多样性研究
1.2.2 生态因子对AOB群落结构的影响
1.3 氨氧化古菌概述
1.3.1 氨氧化古菌多样性研究
1.3.2 AOA在环境中的分布及环境因子对其分布的影响
1.4 厌氧氨氧化细菌概述
1.4.1 厌氧氨氧化细菌生化反应机理
1.4.2 厌氧氨氧化细菌多样性研究
1.5 微生物多样性研究方法
1.5.1 克隆基因文库法
1.5.2 RT-PCR
2 研究目的、内容和技术路线
2.1 研究目的
2.2 研究内容
2.3 研究的技术路线
3 实验材料和方法
3.1 实验材料
3.1.1 样品采集
3.1.2 土壤样品理化指标的测定
3.1.3 实验主要试剂盒
3.1.4 实验主要试剂
3.1.5 实验主要培养基
3.1.6 实验主要引物
3.1.7 实验主要仪器
3.2 实验方法
3.2.1 amoA基因文库的构建
3.2.2 土壤中amoA基因和Anammox菌16S rRNA基因定量分析
3.2.3 amoA基因序列分析
3.2.4 统计学分析方法
4 黑龙江玉米农田土壤氨氧化微生物基因数量研究
4.1 土壤理化指标性质初步研究
4.2 土壤氨氧化微生物基因定量分析
4.2.1 amoA基因定量分析
4.2.2 Anammox细菌16S rRNA基因定量分析
4.3 土壤中amoA基因数量与环境因素之间的关系(RDA分析)
4.4 本章小结
5 黑龙江玉米农田土壤氨氧化微生物群落多样性研究
5.1 壤宏基因组DNA提取结果与分析
5.2 氨氧化古菌amoA基因扩增结果与系统发育分析
5.2.1 氨氧化古菌amoA基因PCR扩增结果与分析
5.2.2 氨氧化古菌amoA基因系统发育树的建立与分析
5.3 氨氧化细菌amoA基因扩增结果与系统发育分析
5.3.1 氨氧化细菌amoA基因PCR扩增结果与分析
5.3.2 氨氧化细菌amoA基因系统发育树的建立与分析
5.4 本章小结
结论
参考文献
附录A
附录B
攻读硕士学位期间发表学术论文情况
致谢
本文编号:3087909
【文章来源】:大连理工大学辽宁省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
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摘要
Abstract
引言
1 文献综述
1.1 土壤氮素循环综述
1.1.1 氮的存在形式
1.1.2 土壤氮素循环
1.2 氨氧化细菌概述
1.2.1 氨氧化细菌多样性研究
1.2.2 生态因子对AOB群落结构的影响
1.3 氨氧化古菌概述
1.3.1 氨氧化古菌多样性研究
1.3.2 AOA在环境中的分布及环境因子对其分布的影响
1.4 厌氧氨氧化细菌概述
1.4.1 厌氧氨氧化细菌生化反应机理
1.4.2 厌氧氨氧化细菌多样性研究
1.5 微生物多样性研究方法
1.5.1 克隆基因文库法
1.5.2 RT-PCR
2 研究目的、内容和技术路线
2.1 研究目的
2.2 研究内容
2.3 研究的技术路线
3 实验材料和方法
3.1 实验材料
3.1.1 样品采集
3.1.2 土壤样品理化指标的测定
3.1.3 实验主要试剂盒
3.1.4 实验主要试剂
3.1.5 实验主要培养基
3.1.6 实验主要引物
3.1.7 实验主要仪器
3.2 实验方法
3.2.1 amoA基因文库的构建
3.2.2 土壤中amoA基因和Anammox菌16S rRNA基因定量分析
3.2.3 amoA基因序列分析
3.2.4 统计学分析方法
4 黑龙江玉米农田土壤氨氧化微生物基因数量研究
4.1 土壤理化指标性质初步研究
4.2 土壤氨氧化微生物基因定量分析
4.2.1 amoA基因定量分析
4.2.2 Anammox细菌16S rRNA基因定量分析
4.3 土壤中amoA基因数量与环境因素之间的关系(RDA分析)
4.4 本章小结
5 黑龙江玉米农田土壤氨氧化微生物群落多样性研究
5.1 壤宏基因组DNA提取结果与分析
5.2 氨氧化古菌amoA基因扩增结果与系统发育分析
5.2.1 氨氧化古菌amoA基因PCR扩增结果与分析
5.2.2 氨氧化古菌amoA基因系统发育树的建立与分析
5.3 氨氧化细菌amoA基因扩增结果与系统发育分析
5.3.1 氨氧化细菌amoA基因PCR扩增结果与分析
5.3.2 氨氧化细菌amoA基因系统发育树的建立与分析
5.4 本章小结
结论
参考文献
附录A
附录B
攻读硕士学位期间发表学术论文情况
致谢
本文编号:3087909
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/nykj/3087909.html