蛋白质乙酰化调控Bacillus nematocida B16杀线虫初探
发布时间:2021-04-05 07:01
植物寄生线虫每年导致巨大的全球农作物经济损失,是限制农业生产的第二大因子,而线虫生物防治因为其绿色安全的特性逐渐成为线虫防治研究的热点。杀线虫芽孢杆菌B16(Bacillus nematocida)对线虫例如松木线虫具有良好的杀虫活性。文献报道蛋白质赖氨酸乙酰化修饰调控细胞各方面的生理活动,那么蛋白质乙酰化是否调控B16与线虫之间的相互作用呢?通过TMT(串联质量标签)标记的LC-MS/MS技术,我们对B16的乙酰化蛋白组进行了测序,并对乙酰化赖氨酸位点的乙酰化水平和蛋白质表达水平进行了定量分析。1.总共在349个蛋白质中鉴定到了529乙酰化位点,使用多种生物信息方法对乙酰化蛋白质进行分析,包括COG功能分类、GO富集分析、KEGG pathway分析、乙酰化肽段二级结构分析和motif分析。通过这些分析发现,在这些蛋白质中22个参与了B16吸引线虫物质的合成,另外,Sec A(K42)和Sec Y(K373)参与了杀线虫蛋白酶的分泌。2.定量分析了杀线虫的过程中线虫对B16蛋白质表达水平的影响。对鉴定到的1980个蛋白中的1592个蛋白质进行了相对定量分析,发现13个蛋白质的表达水平...
【文章来源】:云南大学云南省 211工程院校
【文章页数】:117 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
B16蛋白关联样本检测注:每一泳道上样30μg,M:蛋白marker;1、2道.B16的蛋白(B16);3、4道.线虫处理B16的蛋白(B16C)
MS数据的QC验证
赖氨酸上乙酰化分布(A),与枯草芽孢杆菌乙酰化赖氨酸位点比较(B,C)
本文编号:3119365
【文章来源】:云南大学云南省 211工程院校
【文章页数】:117 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
B16蛋白关联样本检测注:每一泳道上样30μg,M:蛋白marker;1、2道.B16的蛋白(B16);3、4道.线虫处理B16的蛋白(B16C)
MS数据的QC验证
赖氨酸上乙酰化分布(A),与枯草芽孢杆菌乙酰化赖氨酸位点比较(B,C)
本文编号:3119365
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