YajQ家族c-di-GMP受体蛋白XC3703、Smlt4090及根癌农杆菌T6SS衔接蛋白Atu4349结构及功能的

发布时间：2021-06-08 15:28

　　野油菜黄单胞菌野油菜致病变种（Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc）是引起十字花科植物黑腐病的致病菌。Xcc能够在世界范围内感染十字花科植物,从而在种植此类作物的地区造成重大经济损失。嗜麦芽寡养单胞菌（Stenotrophomonas maltophilia）是一种较为罕见的革兰氏阴性条件致病菌,易引起免疫力低下个体出现感染症状。c-di-GMP是一种广为人知的胞内第二信使,参与细菌包括生物被膜合成、细菌毒力、细胞运动等多种重要生理功能。而c-di-GMP的功能是通过细胞内存在的c-di-GMP受体实现的。c-di-GMP通过与受体相互作用而引起下游相应生理生化功能变化从而行使其功能。近期有研究报道YajQ蛋白家族成员中存在一种新型的c-di-GMP受体。YajQ家族蛋白质二级结构在细菌中相对保守,具有潜在的与核酸结合的能力。而Xcc中的YajQ家族成员XC3703被证明能与转录因子XC2801发生相互作用,而其与c-di-GMP的结合能够逆转这种相互作用,从而影响下游基因的表达,影响包括生物被膜形成、细菌毒力等在内的多种重要生物学功能。而S... 

【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：90 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
符号说明
第一部分 XC3703及Smlt4090结构与功能的研究
    第一章 前言
        1.1. 野油菜黄单胞菌野油菜致病变种概述
        1.2 Xcc生物被膜形成及调控
            1.2.1 生物被膜概述
            1.2.2 Xcc生物被膜形成调控机制
        1.3 c-di-GMP调控机制
            1.3.1 c-di-GMP概述
            1.3.2 c-di-GMP受体蛋白质
        1.4 嗜麦芽寡养单胞菌概述
        1.5 课题研究意义及主要内容
    第二章 XC3703及Smlt4090的表达纯化及晶体筛选
        2.1 XC3703蛋白分析
        2.2 Smlt4090蛋白分析
        2.3 材料
            2.3.1 基因组、载体和菌株
            2.3.2 主要试剂及服务
            2.3.3 主要仪器
            2.3.4 主要缓冲液及溶液配制
        2.4 实验方法
            2.4.1 原核表达载体的构建
            2.4.2 蛋白质的表达纯化
            2.4.3 晶体筛选及优化
        2.5 蛋白纯化及晶体生长实验结果
            2.5.1 XC3703的表达纯化结果
            2.5.2 Smlt4090的表达纯化结果
            2.5.3 XC3703的晶体生长及优化结果
            2.5.4 Smlt4090的晶体生长及优化结果
        2.6 本章小结
    第三章 XC3703及Smlt4090衍射数据的收集及结构的解析
        3.1 试剂、材料及仪器
        3.2 衍射数据的收集及结构解析
            3.2.1 衍射数据的测试及收集
            3.2.2 衍射数据的处理
            3.2.3 相位的确定
            3.2.4 模型的构建
            3.2.5 模型的精修
        3.3 结构解析结果
            3.3.1 XC3703结构解析结果及结构分析
            3.3.2 Smlt4090结构解析结果及结构分析
        3.4 本章小结
    第四章 XC3703及Smlt4090功能初步研究
        4.1 实验仪器
        4.2 实验方法
            4.2.1 聚集态分析
            4.2.2 相互作用分析
        4.3 实验结果
            4.3.1 聚集态分析
            4.3.2 XC3703与XC2801相互作用分析
        4.4 本章小结
第二部分 Atu4349的表达纯化及晶体筛选
    第一章 前言
        1.1 根癌土壤杆菌概述
        1.2 六型分泌系统简介
        1.3 Tap蛋白研究进展及实验主要内容
    第二章 Atu4349的表达纯化及晶体筛选
        2.1 Atu4349蛋白分析
        2.2 实验材料
        2.3 实验方法
            2.3.1 原核表达载体的构建
            2.3.2 蛋白质的表达纯化
        2.4 实验结果
            2.4.1 Atu4349蛋白纯化结果
            2.4.2 Atu4349蛋白晶体生长结果
            2.4.3 Atu4349蛋白晶体衍射结果
            2.4.4 Atu4349同源蛋白实验结果
        2.5 本章小结
全文总结
参考文献
致谢
学位论文评阅及答辩情况表



本文编号：3218751