哈茨木霉菌拮抗辣椒疫霉的转录组学研究
发布时间：2021-07-02 14:23
农业生产中由于化肥农药的过度使用,导致生态环境污染、种植地土壤板结退化、农产品农药残留高、产品质量下降等问题日渐严重,选择高效安全的生防菌剂取代化学防治可以很好地解决上述问题。木霉属（Trichoderma spp.）真菌具有极强大的分泌生物防治活性物质能力,能够拮抗多种植物病原真菌,已被广泛应用于农业生物防控。然而,木霉菌发挥生防作用的分子机制尚未明确,这极大地限制了木霉菌的工业化发展。随着木霉基因组的测序完成,基于转录组学技术挖掘木霉菌生防功能基因成为一种有效的手段,研究木霉菌拮抗作用的分子机理,有助于对植物病原菌进行高效的生物防治,减少农业经济损失。本研究以贵州地区分离得到的木霉菌材料,将分离菌株与辣椒疫霉（Phytophthora capsici）对峙培养,检测其抑菌效果,观察拮抗条件下相关生理生化指标的变化,筛选出1株拮抗效果较好的哈茨木霉菌株。通过转录组测序分析比较哈茨木霉菌拮抗辣椒疫霉前（3d）、中（5d）、后（7d）不同时期的显著差异表达和可变剪接基因的功能,进一步探究哈茨木霉菌拮抗性状相关代谢的调控途径,为揭示木霉菌生防作用的分子机制奠定基础。研究内容和结果如下;1、...
【文章来源】：贵州大学贵州省 211工程院校
【文章页数】：138 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
木霉菌菌株进化关系图(Mukherjee,etal.,2013)
图 1.2 基因可变剪辑的类型（引自周冬虎等，2015）Fig. 1.2 The type of gene that forms alternative splicing量测序技术在整个转录组测序（RNA-Seq）中的发展促进了人（AS）的理解。RNA-Seq 数据可以通过跨越内含子的 read别内含子，这对鉴定基因的内含子和剪接多样性有着重要价中有数千个可变剪接事件被发现，甚至于有数十个剪接事件是子进行连（Cloonan, et al.,2008）。不只是高等真核生物，即有大量可变剪接事件通过 RNA-Seq 被发现（Zhao, et al., 201达不论是在物种之间还是在组织个体之间都存在超乎想象的 分析显示，人类多顺反子可变剪接（AS）基因的比例在人类（Pan Q, et al,. 2008; Wang ,et al,.2008)在水稻中为 42.4％（Z拟南芥中为 61％（Marquez,et al,. 2012）。最近一项针对 23
2019 届硕士研究生毕业论文变化现象。2.7 哈茨木霉菌拮抗辣椒疫霉菌的转录组学分析2.7.1 测序样品处理综合分离木霉菌株的平板抑制效率与发酵液的拮抗效果，选取了哈茨木霉菌做转录组测序。将辣椒疫霉先接种于 PDA 平板培养基上 3d 后，在等距离先后点接种哈茨木霉于同一培养基，28 °C 培养 3 d 时发现哈茨木霉与辣椒疫霉均开始正常生长、5 d 时两菌株菌丝生长到平板中央开始接触生长，7d 时哈茨木霉菌丝几乎全部覆盖整个平板，辣椒疫霉不仅停止了生长而且菌丝体被消解，最终确定拮抗 3、5、7d 为拮抗前、中、后 3 个时期样品测序，每个样品设置 3 次重复。
【参考文献】：
期刊论文
[1]不同木霉菌株对黄瓜枯萎病菌的拮抗作用[J]. 谷祖敏,毕卉,张兵,田晓颖. 西北农业学报. 2018(03)
[2]真菌源几丁质酶在植物抗真菌病害中的应用[J]. 程笑笑,冯自力,冯鸿杰,赵丽红,师勇强,李志芳,朱荷琴. 植物保护. 2017(03)
[3]棘孢木霉发酵液对番茄早疫病抗氧化系统和脂质过氧化作用的影响[J]. 杨帅,孙丽丽,邓世林,袁碧玉,苏佳满,王志英,孙卉. 中国农学通报. 2017(05)
[4]组学时代的可变剪接研究进展[J]. 周冬虎,姜颖,贺福初. 中国科学:生命科学. 2015(12)
[5]木霉菌生物防治辣椒疫病的研究进展[J]. 杨万荣,邢丹,蓬桂华,张爱民,付文婷. 现代农业科技. 2015(19)
[6]辣椒疫霉多聚半乳糖醛酸酶活性对其致病力的影响[J]. 李萍,张茜茹,吴亚,高智谋. 安徽农业科学. 2015(19)
[7]黄绿木霉菌发酵液对稻瘟病菌的影响[J]. 林志伟,孙冬梅. 贵州农业科学. 2015(03)
[8]贵州省辣椒疫霉菌生物学特性和辣椒抗疫病性鉴定方法初探[J]. 王莹,王姝,赵玉桥,向准,刘盈盈,张玉武. 湖北农业科学. 2014(20)
[9]长枝木霉菌抑菌谱测定及其抑菌作用机理研究[J]. 张瑾,张树武,徐秉良,古丽君,薛应钰. 中国生态农业学报. 2014(06)
[10]辣椒疫病生物防治技术研究进展[J]. 张爱民,邢丹,杨万荣,杨红. 长江蔬菜. 2013(08)
博士论文
[1]苦参内生真菌抑菌物质纯化鉴定及作用机制研究[D]. 何璐.沈阳农业大学 2011
本文编号：3260635
【文章来源】：贵州大学贵州省 211工程院校
【文章页数】：138 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
木霉菌菌株进化关系图(Mukherjee,etal.,2013)
图 1.2 基因可变剪辑的类型（引自周冬虎等，2015）Fig. 1.2 The type of gene that forms alternative splicing量测序技术在整个转录组测序（RNA-Seq）中的发展促进了人（AS）的理解。RNA-Seq 数据可以通过跨越内含子的 read别内含子，这对鉴定基因的内含子和剪接多样性有着重要价中有数千个可变剪接事件被发现，甚至于有数十个剪接事件是子进行连（Cloonan, et al.,2008）。不只是高等真核生物，即有大量可变剪接事件通过 RNA-Seq 被发现（Zhao, et al., 201达不论是在物种之间还是在组织个体之间都存在超乎想象的 分析显示，人类多顺反子可变剪接（AS）基因的比例在人类（Pan Q, et al,. 2008; Wang ,et al,.2008)在水稻中为 42.4％（Z拟南芥中为 61％（Marquez,et al,. 2012）。最近一项针对 23
2019 届硕士研究生毕业论文变化现象。2.7 哈茨木霉菌拮抗辣椒疫霉菌的转录组学分析2.7.1 测序样品处理综合分离木霉菌株的平板抑制效率与发酵液的拮抗效果，选取了哈茨木霉菌做转录组测序。将辣椒疫霉先接种于 PDA 平板培养基上 3d 后，在等距离先后点接种哈茨木霉于同一培养基，28 °C 培养 3 d 时发现哈茨木霉与辣椒疫霉均开始正常生长、5 d 时两菌株菌丝生长到平板中央开始接触生长，7d 时哈茨木霉菌丝几乎全部覆盖整个平板，辣椒疫霉不仅停止了生长而且菌丝体被消解，最终确定拮抗 3、5、7d 为拮抗前、中、后 3 个时期样品测序，每个样品设置 3 次重复。
【参考文献】：
期刊论文
[1]不同木霉菌株对黄瓜枯萎病菌的拮抗作用[J]. 谷祖敏,毕卉,张兵,田晓颖. 西北农业学报. 2018(03)
[2]真菌源几丁质酶在植物抗真菌病害中的应用[J]. 程笑笑,冯自力,冯鸿杰,赵丽红,师勇强,李志芳,朱荷琴. 植物保护. 2017(03)
[3]棘孢木霉发酵液对番茄早疫病抗氧化系统和脂质过氧化作用的影响[J]. 杨帅,孙丽丽,邓世林,袁碧玉,苏佳满,王志英,孙卉. 中国农学通报. 2017(05)
[4]组学时代的可变剪接研究进展[J]. 周冬虎,姜颖,贺福初. 中国科学:生命科学. 2015(12)
[5]木霉菌生物防治辣椒疫病的研究进展[J]. 杨万荣,邢丹,蓬桂华,张爱民,付文婷. 现代农业科技. 2015(19)
[6]辣椒疫霉多聚半乳糖醛酸酶活性对其致病力的影响[J]. 李萍,张茜茹,吴亚,高智谋. 安徽农业科学. 2015(19)
[7]黄绿木霉菌发酵液对稻瘟病菌的影响[J]. 林志伟,孙冬梅. 贵州农业科学. 2015(03)
[8]贵州省辣椒疫霉菌生物学特性和辣椒抗疫病性鉴定方法初探[J]. 王莹,王姝,赵玉桥,向准,刘盈盈,张玉武. 湖北农业科学. 2014(20)
[9]长枝木霉菌抑菌谱测定及其抑菌作用机理研究[J]. 张瑾,张树武,徐秉良,古丽君,薛应钰. 中国生态农业学报. 2014(06)
[10]辣椒疫病生物防治技术研究进展[J]. 张爱民,邢丹,杨万荣,杨红. 长江蔬菜. 2013(08)
博士论文
[1]苦参内生真菌抑菌物质纯化鉴定及作用机制研究[D]. 何璐.沈阳农业大学 2011
本文编号：3260635
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/nykj/3260635.html
