十字花科黑腐病菌σ因子在致病中的作用研究

发布时间：2021-12-16 06:27

　　细菌利用各种机制来精确地调节自身行为,以响应环境的变化,从而促进细菌生长、生存和侵染。Sigma（σ）因子就是其中一类影响基因表达转录调控的全局信号调控系统。σ因子作为RNA聚合酶（RNA polymerase,RNAP）的重要组成部分,负责识别特异的启动子序列,提高RNA聚合酶辨认启动子的能力。细菌募集各类σ因子调控基因表达,响应不同的环境信号,如温度、渗透压、酸碱、重金属等各种胁迫等。基于结构和功能上的差别,σ因子可分为两类:σ54家族和σ70家族。十字花科黑腐病菌（Xanthomonas campestris pv.campstris,Xcc）是一种能在全球范围内引起所有十字花科植物黑腐病的重要植物病原细菌。本研究对Xccσ因子在致病中的调控作用进行了研究,为进一步阐明Xcc 8004菌株的致病机理提供基础。基于已经测序的Xcc8004基因组序列,我们利用SMART（Simple Modular Architecture Research Tool）（http://smart.embl-heidelberg.de）分析预测得到 15 个 σ 因子:XC1311（RpoN1）和 X... 

【文章来源】：广西大学广西壮族自治区 211工程院校

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【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１－１细菌ＲＮＡ聚合酶全酶示意图（Ｄａｖｉｓ?ｅｔａｌ．，２０１７）??Ｆｉｕｒｅ?１－１?Ｓｃｈｅｍａｔｉｃ?ｒｅｒｅｓｅｎｔａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｂａｃｔｅｒｉａｌ?ＲＮＡＰＲＮＡｏｌｍｅｒａｓｅｈｏｌｏ?ｅｎｚｍｅ??

１．２．２．１?ａ７０家族的结构??（Ｊ？家族是〇因子重要的组成部分，其结构中含有４个高度保守的区域：区??域１、区域２、区域３和区域４，每个区域又可分为几个不同的亚区域（图１－３）。??区域１?（〇１）位于〇因子的Ｎ端，它是４个区域中保守性较低的一段。区域??１又可分为区域１．１和区域１．２。区域１负责将ＤＮＡ从初始的双链闭合状态打开??４??

含保守的区域２和区域４，保证了?〇因子的基本特性：与ＲＮＡ聚合酶核心酶结??合和识别特定的启动子序列，但是它们缺少〇７Ｇ因子中发现的其它保守区域??（Ｆｅｋｌｉｓｔｏｖｅｔａｌ．，２０１４）（图１－４）。ＥＣＦｃｒ因子的主要序列都较保守，而且它们识??别的启动子也很相似，尤其是在－３５区中（Ｌｏｎｅｔｔｏ?ｅｔ?ａｌ．，１９９４；?Ｅｎｚ?ｅｔ?ａｌ．，１９９５）。??所有这些蛋白都可以调控胞质功能基因，并且对胞质信号作出反应（Ｌｏｎｅｔｔｏｅｔａｌ．，??１９９４），这个家族的四个成员ＡｌｇＵ、ａＥＥ。、ＣａｒＱ和ＣｎｒＨ已知或者预测其受同一??操纵子的下游基因负向调控（Ｌｉｅｓｅｇａｎｇ?ｅｔ?ａｌ．，?１９９３；?Ｍａｒｔｉｎ?ｅｔ?ａｌ．，?１９９３；?ＭｃＧｏｗａｎ??ｅｔ?ａｌ．，１９９３；?Ｌｏｎｅｔｔｏ?ｅｔ?ａｌ．，?１９９４），但是也存在着不同的调控机制，比如ＨｒｐＬ是在??转录水平上被ＨｒｐＲ和ＨｒｐＳ这两个类ＮｔｒＣ蛋白激活（Ｘｉａｏ?ｅｔ?ａｌ．，?１９９４）。??ＥＣＦｏ家族现在约有３８０００个基因，由７６７９个细菌基因组组成，构成了细??菌的主要信号转导系统之一（Ｓｔａｒｏｒｉｅｔａｌ．


本文编号：3537657