大蒜根腐病根际土壤真菌群落结构及多样性分析

发布时间：2022-01-09 13:27

　　研究旨在解析根腐病发生时大蒜根际土壤真菌群落结构,明确大蒜根腐病与根际土壤真菌群落多样性变化的关系,探明根腐病发生的微生态机制,为病害的防控提供理论基础。以新疆连续3年的大蒜根腐病发病田的根际土壤为研究对象,采用高通量测序方法对大蒜根际土壤总DNA的真菌ITS区序列进行大规模测序分析。结果表明,与健康对照相比,在门的水平上,子囊菌门和接合菌门真菌是大蒜根腐病根际土壤的优势真菌类群,其中高水平的子囊菌门菌群与病害发生有着密切的关系。在属的水平上,注释获得137个属,其中19个属与大蒜根腐病有较大的相关性。镰刀菌属真菌数量在病土中高于健康对照。随着连作年限的延续,根腐病的发生愈发严重,土壤中真菌群落的Shannon指数、Simpson指数、真菌属的数量逐年降低,大蒜根腐病的发生与植株根际真菌群落组成及多样性密切相关,土壤真菌类群的平衡和多样性改变是根腐病发生的一大诱因。 

【文章来源】：中国农学通报. 2020,36(13)

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

各样品的聚类和注释情况统计

物种累积箱形图

稀释曲线是常见的描述组内样品多样性的曲线。稀释曲线可直接反映测序数据量的合理性，并间接反映样品中物种的丰富程度，当曲线趋向平坦时，说明测序数据量渐进合理。由图3可以看出，无论在单样品水平还是分组水平上，随着序列数量的增加，曲线趋于平坦，表示随着检出序列的增加检测到的物种即OUT数几乎不再增加，表明试验最终分析的数据量较为合理。健康植株根际土壤的物种丰富度明显高于患病大蒜根际土壤。健康土壤物种丰富度在一个种植期内的变化趋势为幼苗期(J1)>抽薹期(J3)>分化期(J2)>成熟期(J4)，健康土壤物种丰富度连续3年变化趋势为2014年(J3)>2015年(J5)>2016年(J6)。病害土壤中物种丰富度在一个种植期内变化趋势为分化期(B2)>抽薹期(B3)>成熟期(B4)，病害土壤中物种丰富度连续3年变化趋势为2014年(B3)>2015年(B5)>2016年(B6)。通过表1的多样性指数可以看出，健康组的物种数、物种多样性、物种均匀度、物种丰度、系统发育多样性显著高于病害组。上述指数在健康组样品中幼苗期(J1)>抽薹期(J3)>分化期(J2)>成熟期(J4),2014年(J3)>2015年(J5)>2016年(J6)；在病害组中分化期(B2)>抽薹期(B3)>成熟期(B4),2014年(B3)>2015年(B5)>2016年(B6)。

【参考文献】：
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硕士论文
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本文编号：3578808