检疫性害虫—枣实蝇分子生物学快速鉴定技术研究
发布时间:2022-02-10 08:38
枣实蝇(Carpomya vesuviana Costa)是2007年首次在新疆吐鲁番地区发现的重大检疫性害虫,系在新疆乃至全国枣产业上有着重要经济意义的害虫。枣实蝇的鉴定是国内外枣贸易中最突出的技术问题之一,建立检疫性枣实蝇特别是未成熟虫态快速可靠的鉴定方法在植物检疫上有重要意义。本研究以国内普遍关注的检疫性害虫枣实蝇为研究对象,测定了枣实蝇的mtDNA COI和Cytb基因部分序列,将获得的基因片段与已公开报道的其它同源序列进行比较分析,设计了枣实蝇15对引物基础上,应用种特异引物PCR(SS-PCR)和SYBR Green实时荧光PCR技术,筛选出了枣实蝇的特异性引物,在此基础上研发了检疫性枣实蝇的分子生物学快速鉴定技术。主要研究结果如下:1.首次提取了枣实蝇基因组DNA,分别测定枣实蝇mtDNACOI两段不同的基因序列和cytb部分基因序列;首次将吐鲁番枣实蝇序列录入GenBank数据库,序列号分为HQ687210,JX515609和JX101439。2.首次以目标枣实蝇线粒体DNA(mtDNA)中COI基因序列(GenBank序列号:HQ687210)为目标序列,借助Mega...
【文章来源】:新疆农业大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】:78 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
Uea7/Uea10引物PCR模板DNA质量电泳图
的正反双链用软件Chromas,对其进行修正源于线粒体的编码区,通过无脊椎动物密终止密码子,所以所测序列不是假基因。排列程序,并人工核对校正。采用分子遗传进化分歧矩阵根据 Kimura 2-paramter 模权组对算术平均法(UPGMA)和邻接法(N树各分支地置信度( boostrap) 均进行 1 000基因一清晰、明亮的电泳条带约在 500 bp,没 PCR 产物与引物设计的要求相符合。
.吐鲁番市枣实蝇 Turpan Carpomya vesuviana Costa;2.HSX 枣实蝇 HSXCarpomya vesuviana Costa;3.HMS 枣实蝇 HCarpomya vesuviana Costa;4.KSS 枣实蝇 KSS Carpomya vesuviana Costa;5. FJ571369.1 樱桃绕实蝇 Rhagoletisalternate;6. FJ571370.1 蔷薇咔实蝇 Carpomya schineri;7. FJ571371.1 蔷薇咔实蝇 Carpomya schineri图 3-2 利用 NJ 法构建 mtDNACytb 基因序列的聚类图Fig.3-2 Dendro gram based on NJ analysis of mtDNA Cytb.吐鲁番市枣实蝇 Turpan Carpomya vesuviana Costa;2.HSX 枣实蝇 HSXCarpomya vesuviana Costa;3.HMS 枣实蝇 HCarpomya vesuviana Costa;4.KSS 枣实蝇 KSS Carpomya vesuviana Costa;5. FJ571369.1 樱桃绕实蝇 Rhagoletisalternate;6. FJ571370.1 蔷薇咔实蝇 Carpomya schineri;7. FJ571371.1 蔷薇咔实蝇 Carpomya schineri图 3-3 利用 UPGMA 法构建 mtDNACytb 基因序列的聚类图Fig.3-3 Dendro gram based on UPGMA analysis of mtDNA Cytb
【参考文献】:
期刊论文
[1]柑橘大实蝇微卫星标记的筛选[J]. 高立志,刘映红,万宣伍,王佳,洪枫. 中国农业科学. 2013(15)
[2]枣实蝇不同地理种群的亲缘关系[J]. 阿地力·沙塔尔,张伟,程晓甜,朱银飞,骆有庆,陈梦. 林业科学. 2012(06)
[3]基于线粒体COⅠ基因的上海地区橘小实蝇种群遗传关系研究[J]. 吴广超,李云龙,李志红,柳丽君. 中国农业大学学报. 2012(02)
[4]桔小实蝇幼体及成虫残体DNA条形码识别技术的建立与应用[J]. 刘慎思,张桂芬,武强,张爱兵,王进军,万方浩. 昆虫学报. 2012(03)
[5]美洲斑潜蝇SS-PCR检测技术研究[J]. 张桂芬,刘万学,郭建英,吕志创,万方浩,申香菊. 生物安全学报. 2012(01)
[6]中国果实蝇属种类的DNA条形码鉴定(双翅目,实蝇科)[J]. 梁亮,江威,余慧,姜帆,李志红,杨定. 动物分类学报. 2011(04)
[7]瓜实蝇普通气味结合蛋白基因的克隆及原核表达[J]. 申建梅,胡黎明,宾淑英,廖泓之,林进添. 华中农业大学学报. 2011(04)
[8]瓜实蝇嗅觉受体基因的克隆及表达谱分析[J]. 申建梅,胡黎明,宾淑英,林进添. 昆虫学报. 2011(03)
[9]应用微卫星标记分析不同桔小实蝇种群的遗传多样性[J]. 吴仲真,李红梅,宾淑英,申建梅,贺华良,罗梅,马骏,林进添. 昆虫学报. 2011(02)
[10]基于DNA条形码技术的泰国番石榴中实蝇幼虫分子鉴定研究[J]. Buahom Nopparat,李志红,吴佳教,刘佳琪. 植物检疫. 2011(01)
博士论文
[1]检疫性实蝇分子生物学快速鉴定技术的研究[D]. 余道坚.中国科学院研究生院(上海生命科学研究院) 2005
硕士论文
[1]恶性血液病侵袭性曲霉菌病AllGlo荧光PCR诊断技术的建立与临床应用实验研究[D]. 吴淡森.福建医科大学 2009
[2]地中海实蝇及其近缘种和桔小实蝇复合种基因芯片的研制及应用[D]. 李文芬.湖南师范大学 2008
[3]五种实蝇的分子系统发育分析与分子快速鉴定研究[D]. 张长禹.华中农业大学 2007
本文编号:3618590
【文章来源】:新疆农业大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】:78 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
Uea7/Uea10引物PCR模板DNA质量电泳图
的正反双链用软件Chromas,对其进行修正源于线粒体的编码区,通过无脊椎动物密终止密码子,所以所测序列不是假基因。排列程序,并人工核对校正。采用分子遗传进化分歧矩阵根据 Kimura 2-paramter 模权组对算术平均法(UPGMA)和邻接法(N树各分支地置信度( boostrap) 均进行 1 000基因一清晰、明亮的电泳条带约在 500 bp,没 PCR 产物与引物设计的要求相符合。
.吐鲁番市枣实蝇 Turpan Carpomya vesuviana Costa;2.HSX 枣实蝇 HSXCarpomya vesuviana Costa;3.HMS 枣实蝇 HCarpomya vesuviana Costa;4.KSS 枣实蝇 KSS Carpomya vesuviana Costa;5. FJ571369.1 樱桃绕实蝇 Rhagoletisalternate;6. FJ571370.1 蔷薇咔实蝇 Carpomya schineri;7. FJ571371.1 蔷薇咔实蝇 Carpomya schineri图 3-2 利用 NJ 法构建 mtDNACytb 基因序列的聚类图Fig.3-2 Dendro gram based on NJ analysis of mtDNA Cytb.吐鲁番市枣实蝇 Turpan Carpomya vesuviana Costa;2.HSX 枣实蝇 HSXCarpomya vesuviana Costa;3.HMS 枣实蝇 HCarpomya vesuviana Costa;4.KSS 枣实蝇 KSS Carpomya vesuviana Costa;5. FJ571369.1 樱桃绕实蝇 Rhagoletisalternate;6. FJ571370.1 蔷薇咔实蝇 Carpomya schineri;7. FJ571371.1 蔷薇咔实蝇 Carpomya schineri图 3-3 利用 UPGMA 法构建 mtDNACytb 基因序列的聚类图Fig.3-3 Dendro gram based on UPGMA analysis of mtDNA Cytb
【参考文献】:
期刊论文
[1]柑橘大实蝇微卫星标记的筛选[J]. 高立志,刘映红,万宣伍,王佳,洪枫. 中国农业科学. 2013(15)
[2]枣实蝇不同地理种群的亲缘关系[J]. 阿地力·沙塔尔,张伟,程晓甜,朱银飞,骆有庆,陈梦. 林业科学. 2012(06)
[3]基于线粒体COⅠ基因的上海地区橘小实蝇种群遗传关系研究[J]. 吴广超,李云龙,李志红,柳丽君. 中国农业大学学报. 2012(02)
[4]桔小实蝇幼体及成虫残体DNA条形码识别技术的建立与应用[J]. 刘慎思,张桂芬,武强,张爱兵,王进军,万方浩. 昆虫学报. 2012(03)
[5]美洲斑潜蝇SS-PCR检测技术研究[J]. 张桂芬,刘万学,郭建英,吕志创,万方浩,申香菊. 生物安全学报. 2012(01)
[6]中国果实蝇属种类的DNA条形码鉴定(双翅目,实蝇科)[J]. 梁亮,江威,余慧,姜帆,李志红,杨定. 动物分类学报. 2011(04)
[7]瓜实蝇普通气味结合蛋白基因的克隆及原核表达[J]. 申建梅,胡黎明,宾淑英,廖泓之,林进添. 华中农业大学学报. 2011(04)
[8]瓜实蝇嗅觉受体基因的克隆及表达谱分析[J]. 申建梅,胡黎明,宾淑英,林进添. 昆虫学报. 2011(03)
[9]应用微卫星标记分析不同桔小实蝇种群的遗传多样性[J]. 吴仲真,李红梅,宾淑英,申建梅,贺华良,罗梅,马骏,林进添. 昆虫学报. 2011(02)
[10]基于DNA条形码技术的泰国番石榴中实蝇幼虫分子鉴定研究[J]. Buahom Nopparat,李志红,吴佳教,刘佳琪. 植物检疫. 2011(01)
博士论文
[1]检疫性实蝇分子生物学快速鉴定技术的研究[D]. 余道坚.中国科学院研究生院(上海生命科学研究院) 2005
硕士论文
[1]恶性血液病侵袭性曲霉菌病AllGlo荧光PCR诊断技术的建立与临床应用实验研究[D]. 吴淡森.福建医科大学 2009
[2]地中海实蝇及其近缘种和桔小实蝇复合种基因芯片的研制及应用[D]. 李文芬.湖南师范大学 2008
[3]五种实蝇的分子系统发育分析与分子快速鉴定研究[D]. 张长禹.华中农业大学 2007
本文编号:3618590
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/nykj/3618590.html