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二化螟盘绒茧蜂寄生胁迫下的二化螟转录组分析及差异性表达的热激蛋白研究

发布时间:2022-02-14 20:48
  水稻二化螟Chilosuppressalis(Walker)隶属鳞翅目 Lepidoptera、螟蛾总科 Pyraloidea、禾草螟属Chilo。该虫其分布广泛、适应性强,是目前影响我国水稻稳产、高产的重要害虫之一。二化螟盘绒茧蜂(Cotesiachiloni)隶属膜翅目Hymenoptera、茧蜂科Braconidae、绒茧蜂属Apanteles,是水稻二化螟的重要寄生蜂之一,对二化螟田间种群起着重要的控制作用。但是,二化螟和二化螟盘绒茧蜂协同进化的机制以及二化螟应对二化螟盘绒茧蜂寄生的策略还不清楚。本研究通过比较分析二化螟盘绒茧蜂寄生胁迫下的二化螟和未被寄生的二化螟的转录组数据,研究了二化螟4种热激蛋白对二化螟盘绒茧蜂寄生胁迫下的表达特征,同时进一步揭示它们对温度响应的规律。这些结果不仅充实了寄主—寄生蜂的协调进化理论,也为利用二化螟盘绒茧蜂防治二化螟提供理论支撑。主要研究结果如下:1、运用转录组测序技术,测定了被二化螟盘绒茧蜂寄生的二化螟和未被寄生的二化螟转录组。通过比较发现寄生胁迫下的水稻二化螟体内表达存在差异的Unigenes有5685个,在昆虫激素的生物合成、氧化磷酸化、... 

【文章来源】:扬州大学江苏省

【文章页数】:83 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

二化螟盘绒茧蜂寄生胁迫下的二化螟转录组分析及差异性表达的热激蛋白研究


图2-1二化螟转录组测序流程图??Fig?2-1?The?flow?chart?of?the?transcriptome?date?of?C/ii/o?suppressalis??

示意图,示意图,序列集,平均长度


primary?UniGene?进行二次拼接,得到一个?Final?UniGene?序列集合,共?65727?个?UniGene,??其平均长度为891bp。其中,400-1000bp的有50975个,占总数的77.56%;?1000-2000bp的??有7849个,占总数的11.94%;?22000bp的有6903个,占总数10.5%?(图2-6)。??

频数分布,频数分布,长度,数据预处理


123456789?15-19?30-34?45-49?60-64?75-79?50-94?105-109?120-124?135-139?150??Position?in?read?(bp)??图2-5械基分布示意图??Fig?2-5?Schematic?of?base?distribution??2.2.2.2数据预处理??由于测序得到Raw?Reads中可能含有总体质量较低、含有测序引物、末端质量偏低等不??合格的Reads,这些不合格的Reads很有可能对分析质量造成一定的影响,所以必须对其进??行过滤,得到可用于数据分析的dean?Reads,结果统计见表2-2。??表2-2数据预处理结果统计??Table?2-2?The?statistics?of?data?preprocessing??rRNA??Sample?ID?Raw?reads?Clean?reads?Clean?ratio?rRNA?trimed???????????ratio??JSEHM?89435504?82799584?92.58%?82772309?0.04%??WJSEHM?49914502?46684838?93.53%?46671580?0.03%??注:Clean?mtio=(Clean?reads/Ra\'.?reads}%;?rRNA?ratio=[(Clean?reads?-?1.RNA?trimed)/?Clean?reads]%??2.2.2.3转录本组装??对UniGene进行两次拼接

【参考文献】:
期刊论文
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硕士论文
[1]扬州地区二化螟寄生蜂发生动态及其盘绒茧蜂的研究应用[D]. 严卫飞.扬州大学 2017



本文编号:3625246

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