五种植被覆盖下红壤的细菌群落结构组成及其特征

发布时间：2025-04-15 03:25

　　 采用16S rDNA扩增子测序方法探究了5种植被[艾草(Artemisia argyi)、一年蓬(Erigeron annuus)、马唐(Digitaria sanguinalis)、鬼针草(Bidens pilosa)和飞扬草(Euphorbia hirta)]根际的微生物群落.结果表明,变形杆菌(37.8%±2.1%)、酸杆菌门(17.7%±3.8%)和拟杆菌门(16.5%±6.15%)为此片红壤的主要优势菌群.植被类型在一定程度上影响了根际土壤细菌群落丰度及多样性.在门水平,鬼针草土样中的拟杆菌门和硝化螺旋菌门、一年蓬土样中的放线菌门相对富集;在目水平,假单胞菌目和噬纤维菌目分别在艾草土样和鬼针草土样中相对富集.样本共有的OTUs数目约占各个样本OTUs总数的50%,各样品特有的OTUs占比1%～4%.不同植被覆盖下土样细菌的α-多样性指数无显著性差异,飞扬草土样的物种丰度(Chao1=2 388)和多样性指数(H′=9.508)略高于其它样品,艾草土样的物种丰度(Chao1=2 154)和多样性指数最低(H′=8.964).PCoA与OTU聚类分析显示,鬼针草土样与飞扬草土样的...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品收集
    1.2 土壤总基因组DNA的提取和16S rRNA基因片段的扩增
        1.2.1 样品处理与全基因组的提取
        1.2.2 细菌16S rRNA基因片段的扩增
    1.3 扩增子Miseq高通量测序
    1.4 原始序列的处理与统计
    1.5 土壤细菌菌群结构和多样性分析
        1.5.1 细菌菌群结构分析
        1.5.2 细菌多样性分析
2 结果与分析
    2.1 不同土壤微生物群落的α-多样性
    2.2 土壤细菌群落结构组成和核心种群
    2.3 不同土壤样品菌群结构相似性和β-多样性
3 结论与讨论



本文编号：4039994