基于MiSeq测序分析新疆泥火山土壤细菌群落多样性

发布时间：2017-06-24 04:09

  本文关键词：基于MiSeq测序分析新疆泥火山土壤细菌群落多样性，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：【目的】以新疆乌苏泥火山土壤为研究对象,了解泥火山细菌群落结构及其时空动态变化。【方法】选择泥火山4种不同生境土壤在4、7、11月份采样,应用Illumina Mi Seq测序技术测定泥火山土壤细菌的16S r RNA基因V3 V4变异区序列,分析乌苏泥火山不同生境土壤细菌群落组成。【结果】泥火山土壤细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为29 005,在细菌门水平上共有38种细菌类群,Proteobacteria、Actinobacteria、Bacteroidetes为优势菌群,在属水平上共有72种细菌类群,其中含量最高的是未分类细菌;多样性分析表明生境D的丰度指数和多样性指数最高,将泥火山细菌群落多样性与理化因子结合分析,发现其多样性随着土壤养分的增加而基本降低,说明物种多样性指数与理化因子之间呈负相关关系;OTU水平的分析表明生境A的群落组成在时空动态上没有显著差异,其样品群落组成较为相似,而生境C的物种组成差异较大。【结论】相比较于传统方法,Mi Seq测序能够更全面解析环境样品中微生物多样性,揭示了乌苏泥火山群蕴含着丰富的微生物资源,这将为深入研究泥火山生态系统奠定基础,为合理利用和开发泥火山微生物资源提供指导。
【作者单位】： 石河子大学生命科学学院;
【关键词】： 泥火山 优势菌群 MiSeq测序 细菌群落
【基金】：国家自然科学基金项目(No.30860001)~~
【分类号】：S154.3
【正文快照】： 泥火山是由泥浆形成的,只因它的喷发形式和喷发后形成的堆积物在外形上与火山有些相似,因此称其泥火山[1]。新疆乌苏具有亚洲最大的泥火山群,其特殊的环境是研究微生物资源的最佳场所[2]。土壤微生物是土壤的重要组成部分,土壤微生物群落的变化在一定程度上可以反映土壤质量的

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本文编号：477079