计算机辅助药物设计对FXa抑制剂和苯并噻唑衍生物的研究

发布时间：2017-03-30 00:19

  本文关键词：计算机辅助药物设计对FXa抑制剂和苯并噻唑衍生物的研究，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：凝血因子Xa(FXa)是新的抗凝治疗一个特别有希望的靶标。第一种口服Xa因子抑制剂已在欧盟和加拿大于2008年被批准上市。在本文中,38个[6,6，5]三环稠合的恶唑烷酮类分子采用3D-QSAR(三维定量构效关系)、分子对接、分子动力学和Topomer CoMFA来建立三维构效关系模型。CoMFA(比较分子场分析)模型的q2=0.511和tr=0.984,COMSIA(比较分子相似性分析)模型的q2=0.700和r2=0.993,Topomer CoMFA模型的q2=0.377和r2=0.886。结果表明立体场、疏水场、氢键受体场和静电场在模型中发挥关键作用。分子对接和分子动力学探索了配体和受体蛋白之间相互作用的机制。苯并噻唑是一个重要的药效结构,在医药领域有着广泛的应用。苯并噻唑2-取代化合物对人肝癌细胞HepG2有着一定的抗增殖活性。在本文中,对31个苯并噻唑衍生物采用了3D-QSAR和Topomer CoMFA来建立三维构效关系模型。CoMFA模型的q2=0.653和r2=0.921,COMSIA模型的q2=0.708和r2=0.917,Topomer CoMFA模型的q2=0.386和r2=0.649。计算结果表明： (1)较大的R1基团和较小的R2基团有利于活性；(2)R2基团可以通过在4-和6-取代位引入疏水性基团来提高活性。这些结果都表明了3D-QSAR模型是可靠的,可以用来预测新化合物的活性。
【关键词】：计算机辅助药物设计 三维定量构效关系 FXa抑制剂 苯并噻唑衍生物 HepG2
【学位授予单位】：上海应用技术大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：TQ460.1;TP391.7
【目录】：

• 摘要5-6
• Abstract6-9
• 第1章 文献综述9-16
• 1.1 血栓9
• 1.2 抗血栓药物9-12
• 1.2.1 溶血栓药物9
• 1.2.2 抗血小板药物9-11
• 1.2.2.1 ADP受体拮抗剂9-10
• 1.2.2.2 GPⅡb/Ⅲa受体拮抗剂10
• 1.2.2.3 花生四稀酸代谢途径的抑制剂10
• 1.2.2.4 增加血小板内环磷酸腺苷(cAMP)的药物10-11
• 1.2.3 抗凝血药物11-12
• 1.2.3.1 肝素类11
• 1.2.3.2香豆素类11
• 1.2.3.3 直接凝血酶抑制剂11
• 1.2.3.4 Xa因子抑制剂11-12
• 1.3 计算机辅助药物设计12-15
• 1.3.1 定量构效关系13
• 1.3.2 药效团模型13-14
• 1.3.3 分子对接14
• 1.3.4 分子动力学模拟14-15
• 1.4 本文的研究内容和意义15-16
• 第2章 FXa抑制剂的分子模拟研究16-36
• 2.1 数据来源和研究方法16-22
• 2.1.1 数据来源16-18
• 2.1.2 建立模型18-20
• 2.1.3 分子对接20-22
• 2.1.4 分子动力学模拟22
• 2.2 结果与讨论22-34
• 2.2.1 模型结果分析22-30
• 2.2.1.1 3D-QSAR模型结果分析22-28
• 2.2.1.2 Topomer CoMFA模型结果分析28-29
• 2.2.1.3 药效团模型分析29-30
• 2.2.2 分子对接结果分析30-32
• 2.2.3 分子动力学结果分析32-34
• 2.3 本章小结34-36
• 第3章 苯并噻唑衍生物的分子模拟研究36-46
• 3.1 研究背景36
• 3.2 数据来源和研究方法36-39
• 3.2.1 数据来源36-38
• 3.2.2 建立模型38-39
• 3.2.2.1 3D-QSAR模型结果分析38
• 3.2.2.2 Topomer CoMFA模型结果分析38-39
• 3.3 结果与讨论39-45
• 3.3.1 3D-QSAR模型结果分析39-44
• 3.3.2 Topomer CoMFA模型结果分析44-45
• 3.4 本章小结45-46
• 第4章 全文总结46-47
• 参考文献47-53
• 致谢53-54
• 攻读硕士学位期间发表的学术论文54

  本文关键词：计算机辅助药物设计对FXa抑制剂和苯并噻唑衍生物的研究，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：275783