大数据下激活和抑制人左脑基于不同物质结合的外泌体认知的新网络

发布时间：2024-06-27 22:27

　　本文从GEO GDS2678构建的441个在人类左脑相比于黑猩猩左脑显著性高表达的基因(SAM算法(倍数变化≥2))组成的总CC数据库之中,原创构建了对应的激活或者抑制分子的CC数据库,并进一步分别构建USP14,AK3P1,BAG5,HERC2P3,ARF6以及STAT2的激活或抑制两两正相关分子库。根据GRNInfer并整合DAVID和MAS 3.0构建上述分子的人左脑直接激活或抑制的上下游反馈分子和知识网络。结果显示USP14,AK3P1,BAG5,HERC2P3,ARF6以及STAT2来自于人左脑并与认知相关,均含外泌体。其中USP14下游激活网络包括细胞质、线粒体、细胞基质、质膜、细胞质核周区、膜、溶酶体膜、质膜整体成分、膜的整体成分和溶酶体,以此提出并验证USP14网络通过除核外的病毒受体激活基于外泌体的认知;AK3P1下游激活网络包含细胞质、细胞核、细胞基质、线粒体、核质和膜,以此提出并验证AK3P1网络通过蛋白质、ATP和poly(A)RNA结合激活基于外泌体的认知;BAG5上游激活网络则含细胞核、核质、细胞质、细胞质基质、膜,从而提出并验证基于外泌体的认知通过蛋白质和...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２－１通过ＧＲＮＩｎｆｅｒ构建基于计算的人左脑下游直接激活分子网络

溶酶体相关膜蛋白?２?（ＬＡＭＰ２），?Ｃ１?型?Ｎｉｅｍａｍｉ－Ｐｉｃｋ?病（ＮＰＣ１），?ｐｌｅｃｋｓｔｒｉｎ?同??源性如结构域家族Ｂ成员１?（ＰＨＬＤＢ１）以及跨膜蛋白６３Ａ?（ＴＭＥＭ６３Ａ）。具体??分子网络见图２－１。??｛?ＥＭＰＰ２Ｊ?］?；?（ＮＨＢ８?＊｝?....

图３－１通过ＧＲＮＩｎｆｅｒ构建基于计算的人左脑下游直接激活分子网络

（ＲＦＫ），富含丝氨酸／精氨酸的剪接因子７（ＳＲＳＦ７），ＳＭＧ１磷脂酰肌醇３－激酶??相关激酶（ＳＭＧ１），血影蛋白红细胞（ＳＰＴＢ）以及电压依赖性阴离子通道??２?（?ＶＤＡＣ２）等，具体网络见

图４－１通过ＧＲＮＩｎｆｅｒ构建基于计算的似Ｇ５人左脑上游直接激活分子网络

成员２?（ＰＤＩＡ２），蛋白磷酸酶１调节亚基１３Ｂ?（ＰＰＰ１Ｒ１３Ｂ），视网膜母细胞瘤结??合蛋白６ＣＲＢＢＰ６），核糖核酸酶Ｐ／ＭＲＰ?１４ｋＤａ亚基（ＲＰＰ１４），染色体５（ＳＭＣ５）??以及锌指和含有４３的ＢＴＢ结构域（ＺＢＴＢ４３）的结构维持，具体网络见图４－１。??图....

图６－ｌ通过ＧＲＮＩｎｆｅｒ构建基于计算的』ｉ？仲人左脑下游直接抑制分子网络

筛选ＡＲＦ６ＣＣ彡０．２５的分子，从总Ｐｅａｒｓｏｎ相关系数（ＣＣ）数据库之中，??通过ＳＰＳＳ计算ＧＥＯ?ＧＤＳ２６７８数据库，筛选４４１个在人类左脑相比于黑猩猩左??脑中显著性高表达的基因（ＳＡＭ算法（倍数变化彡２）），并构建其抑制分子的??ＣＣ数据库；紧接着，进一步分别计算....

本文编号：3996022