基于在线数据库挖掘miR-202-3p和miR-15b-5p在复发难治性正常核型急性髓系白血病中的作用

发布时间：2024-03-20 04:06

　　目的:miRNA在急性髓系白血病(AML)的发生发展过程中发挥重要作用。目前有关miRNA的分子生物学研究中已取得了一定进展,但miRNA在AML中的作用仍有待挖掘。本文旨在利用GEO数据库筛选在复发难治性正常核型急性髓系白血病(NK-AML)中差异表达的miRNAs(Differentially Expressed miRNAs,DE miRNAs),并分析DE miRNAs在NK-AML中的作用。方法:1.利用在线数据库GEO下载NK-AML骨髓或外周血组织的miRNA表达谱数据,将数据分为复发难治组与无复发组,借助R软件获得两组样本中差异表达明显的miRNAs,利用GraphPad Prism7软件进行生存分析,绘制生存曲线。2.通过在线预测网站预测DE miRNAs的靶基因,对靶基因进行GO功能富集分析,KEGG通路富集分析,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建靶基因的蛋白-蛋白互作网络(Protein-protein interaction network,PPI network),并找出其关键基因。3.利用GEO下载NK-AML外周血组织的基因表达谱数据,分为...

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【部分图文】：

图1miR-202-3p生存曲线

中国医科大学硕士学位论文63结果3.1差异miRNA的筛选从NCBI-GEO数据库中下载GSE55770微阵列数据，此数据集比较特殊，我们只找到30个miRNA。使用校正后的P<0.1和|log2FC|>0.4作为筛选条件，我们获得了两个下调的差异miRNA：miR-202-3p....

图2miR-15b-5p生存曲线

中国医科大学硕士学位论文7图2miR-15b-5p生存曲线3.3靶基因预测结果对miR-202-3p、miR-15b-5p进行靶基因预测，通过TargetScan和miRTarBase在线预测数据库预测靶基因。预测到miR-202-3p靶基因数目分别为2915、206个，利用在线....

图3无复发与复发难治性NK-AML差异miRNAs的靶基因预测

中国医科大学硕士学位论文7图2miR-15b-5p生存曲线3.3靶基因预测结果对miR-202-3p、miR-15b-5p进行靶基因预测，通过TargetScan和miRTarBase在线预测数据库预测靶基因。预测到miR-202-3p靶基因数目分别为2915、206个，利用在线....

图4miR-202-3p靶基因GO及KEGG富集分析

中国医科大学硕士学位论文10图4miR-202-3p靶基因GO及KEGG富集分析

本文编号：3932934