当前位置:主页 > 科技论文 > 搜索引擎论文 >

鲤EST标记与耐低温性状的相关性分析及定位

发布时间:2018-11-17 13:29
【摘要】:利用GLM模型对12个表达序列标签(expressed sequence tag,EST)标记的基因型与鲤耐低温性状进行相关性分析,然后使用OneMap软件将这些EST标记进行连锁定位研究,并通过Blast x搜索引擎对这些候选EST进行注释。结果显示,EST标记CC009(P0.05)和CC115(P0.01)与鲤鱼耐低温性状显著相关;12个EST标记中有8个标记分别连锁定位到6个连锁群中,其中与耐低温相关的CC009和CC115分别定位到鲤连锁图谱的第38号连锁群和第2号连锁群;蛋白质数据库同源性比对发现,CC009与斑马鱼(Danio rerio)尿嘧啶激酶1(uridine-cytidine kinaseI)的同源性高达94%;而CC115为原绿球藻(Prochlorococcus marinus str)的假定糖基转移酶(putative glycosyl transferase)的同源性为56%。
[Abstract]:GLM model was used to analyze the correlation between the genotypes of 12 expression sequence tag (expressed sequence tag,EST) markers and the chilling tolerance traits of common carp, and then the linkage mapping of these EST markers was studied by OneMap software. These candidate EST are annotated by Blast x search engine. The results showed that EST markers CC009 (P0.05) and CC115 (P0.01) were significantly correlated with the low temperature tolerance of carp. Of the 12 EST markers, 8 were linked to 6 linkage groups, among which CC009 and CC115, which were related to low temperature tolerance, were located in the linkage group 38 and 2 of the linkage map of common carp respectively. The homology of CC009 and (Danio rerio) uropyrimidine kinase 1 (uridine-cytidine kinaseI) in protein database was as high as 94, while that of CC115 as the hypothetical glycosyltransferase (putative glycosyl transferase) of Chlorella (Prochlorococcus marinus str) was 56.5%.
【作者单位】: 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院;
【基金】:国家重点基础研究发展计划“973”(2010CB126305) 农业部水产生物技术重点开放实验室(2009NYBZS-05) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2009HSYZX-SJ-05)
【分类号】:S917.4;Q953

【参考文献】

相关期刊论文 前10条

1 杨清香,曹军卫,黄国锦;糖基转移酶和去糖基化酶[J];氨基酸和生物资源;1997年02期

2 李勇;丁雷;李言;侯宁;常玉梅;梁利群;雷清泉;;低温对鲤鱼的5个基因在不同组织中表达量的影响[J];动物学报;2008年03期

3 常玉梅;梁利群;孙效文;曹鼎臣;雷清泉;;低温鲤鱼血清pH值的变化[J];东北农业大学学报;2006年03期

4 梁利群,孙效文;鲤耐寒性状分子标记在遗传连锁图上的定位[J];大连水产学院学报;2003年04期

5 季旭;孙效文;杨立更;李雅娟;刘海金;;微卫星标记对牙鲆有丝分裂雌核发育家系的亲子鉴定[J];动物学研究;2008年01期

6 潘贤;梁利群;雷清泉;;筛选与鲤鱼抗寒性状相关的微卫星分子标记[J];哈尔滨工业大学学报;2008年06期

7 梁利群;常玉梅;邹庆薇;雷清泉;;鲤NADH泛醌氧化还原酶亚基3基因的克隆及低温适应相关性分析[J];吉首大学学报(自然科学版);2009年05期

8 常玉梅;匡友谊;曹鼎臣;梁利群;孙效文;雷清泉;;低温胁迫对鲤血液学和血清生化指标的影响[J];水产学报;2006年05期

9 高国强;常玉梅;匡友谊;梁利群;;利用OneMap软件构建鲤遗传连锁图谱[J];水产学报;2010年05期

10 张晓;吴海珍;卫玮;徐红艳;张元兴;;大黄鱼类Ⅳ型抗冻蛋白基因的克隆、表达及功能研究[J];食品与药品;2009年09期

【共引文献】

相关期刊论文 前10条

1 刘星;仇雪梅;高祥刚;赫崇波;;基因文库构建及其在鱼类遗传研究上的应用[J];现代农业科技;2008年16期

2 李勇;丁雷;李言;侯宁;常玉梅;梁利群;雷清泉;;低温对鲤鱼的5个基因在不同组织中表达量的影响[J];动物学报;2008年03期

3 朱斐;转基因技术及在水产养殖育种上的应用[J];水产科学;2005年07期

4 郑陶生;肖调义;吴宝林;许宝红;;湘华鲮、墨鲮、华鲮遗传多样性的RAPD分析[J];水产科学;2009年04期

5 张琼;刘小林;李喜莲;薛姝雯;辛静静;黄皓;相建海;;EST-SSR分子标记在水生动物遗传研究中的应用[J];水产科学;2010年05期

6 龙华;付元帅;陈戟;赵刚;刘江东;陈建武;余其兴;;染色体研究的新方法与新进展[J];长江大学学报(自科版)农学卷;2006年01期

7 王桂兴;刘永新;孙效文;刘海金;;牙鲆微卫星分子标记与生长性状的相关性分析[J];东北农业大学学报;2009年07期

8 刘永新;王桂兴;王玉芬;司飞;孙朝徽;张晓彦;刘海金;;基于双单倍体牙鲆挖掘与生长性状连锁的微卫星标记[J];东北农业大学学报;2011年09期

9 高俊生;孙效文;梁利群;;鲤抗寒性状的RAPD标记转化为SCAR标记的研究[J];大连水产学院学报;2007年03期

10 卫二建;朱新平;郑光明;陈昆慈;赵建;叶卫;;珠江鲮的形态变异及与人工繁殖群体的比较[J];大连水产学院学报;2007年05期

相关会议论文 前4条

1 张博;杜生明;黄敏仁;;林木遗传图谱研究现状及发展趋势[A];全国作物细胞工程与分子技术育种学术研讨会论文集[C];2003年

2 简清;白俊杰;叶星;夏仕玲;劳海华;罗建仁;;转红色荧光蛋白基因斑马鱼的构建[A];全国首届动物生物技术学术研讨会论文集[C];2004年

3 杨舒心;雷连成;;胸膜肺炎放线杆菌菌影疫苗免疫仔猪前后差异表达基因的鉴定与分析[A];中国畜牧兽医学会生物制品学分会中国微生物学会兽医微生物学专业委员会2010年学术年会(第三届中国兽药大会学术论坛)论文集[C];2010年

4 张跃;朱新平;郑光明;罗建仁;夏仕玲;;鲮鱼的RAPD遗传分析[A];面向21世纪的中国生物多样性保护——第三届全国生物多样性保护与持续利用研讨会论文集[C];1998年

相关博士学位论文 前10条

1 徐荣燕;嗜热真菌糖苷酶的基因克隆、表达与分子改造[D];山东农业大学;2010年

2 王大玮;杜仲遗传连锁图谱构建及重要性状的分子标记[D];西北农林科技大学;2011年

3 李喜莲;凡纳滨对虾肌肉组织中体重调控相关基因的筛选、克隆鉴定及功能研究[D];西北农林科技大学;2011年

4 葛宇;大白菜UGMS遗传图谱的构建及重要农艺性状的QTL分析[D];沈阳农业大学;2011年

5 林红;远缘杂交法结合RAPD技术对鲢、团头鲂遗传图谱的构建[D];南京农业大学;2000年

6 尹明安;胡萝卜(Daucus carota)抗冻蛋白基因的克隆及其对番茄(Lycopersicon esculentum)的转化[D];西北农林科技大学;2001年

7 岳志芹;中国对虾抗病选育群体的遗传分析及遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2003年

8 李莉;长牡蛎的分子标记筛选和遗传图谱构建[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2003年

9 蒙子宁;中国近海小黄鱼、带鱼和小带鱼的遗传多样性以及八种石首鱼类的分子系统进化[D];厦门大学;2003年

10 戴大鹏;结球白菜结球期叶片的表达序列标签及基因表达分析[D];首都师范大学;2004年

相关硕士学位论文 前10条

1 郭姗姗;臭氧处理对冰温保鲜脆肉鲩鱼片品质的影响[D];华中农业大学;2010年

2 陆景标;高丹草SSR引物电子PCR及遗传多态性分析[D];安徽农业大学;2010年

3 毕金贞;带鱼微卫星标记的开发和微卫星标记在牙鲆选择育种中的应用[D];中国海洋大学;2010年

4 鲜雪梅;温度对南方鲇幼鱼皮肤呼吸代谢的影响[D];重庆师范大学;2011年

5 张光忠;基于基因组的金针菇遗传连锁图的构建与数量性状位点(QTL)分析[D];福建农林大学;2011年

6 庞欢;小麦抗性淀粉含量的遗传分析及QTL定位研究[D];石河子大学;2010年

7 周鹏;若干大黄鱼性腺发育相关基因的克隆与表达[D];集美大学;2009年

8 罗在礼;外源p204和cbfa1对斑马鱼胚胎发育和骨生成的影响[D];山东大学;2011年

9 毕承武;江西斑点叉尾洶养殖种群遗传多样性及其分子检测[D];南昌大学;2011年

10 胡玉珍;低温选择大黄鱼子代SSR分析及越冬季节生理生化指标变化[D];宁波大学;2011年

【二级参考文献】

相关期刊论文 前10条

1 张于光,李迪强,饶力群,肖启明,刘丹;东北虎微卫星DNA遗传标记的筛选及在亲子鉴定中的应用[J];动物学报;2003年01期

2 杨芳,贺智敏,詹显全,陈主初,严斌,黄宏科,李廷宝;大鲵肝脏组织定向cDNA文库的构建及鉴定[J];动物学报;2004年03期

3 李勇;丁雷;李言;侯宁;常玉梅;梁利群;雷清泉;;低温对鲤鱼的5个基因在不同组织中表达量的影响[J];动物学报;2008年03期

4 汪永庆,王新国,徐来祥,张知彬;一种动物基因组DNA提取方法的改进[J];动物学杂志;2001年01期

5 邓会山,桂远明,王冬梅;鱼血红细胞膜流动性的研究[J];大连水产学院学报;1993年01期

6 桂远明,吴垠,祝国芹,,沈成钢;几种养殖鱼类越冬生理生化指标的变化Ⅰ─—血液指标及代谢率[J];大连水产学院学报;1994年03期

7 沈俊宝;刘明华;;荷包红鲤抗寒品系的筛选和培育[J];淡水渔业;1988年03期

8 马长艳,周开亚,郭豫杰,王义权,赵乃刚,汪朝晖;中华绒螯蟹卵巢差减cDNA文库的构建[J];动物学研究;2003年01期

9 朱晓琛;刘海金;孙效文;薛玲玲;毛连菊;;微卫星评价牙鲆雌核发育二倍体纯合性[J];动物学研究;2006年01期

10 巩鹏涛;木金贵;赵金荣;王晓玲;白羊年;方宣钧;;一张含有315个SSR和40个AFLP标记的大豆分子遗传图的整合[J];分子植物育种;2006年03期

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 陈文波;刘黎黎;李文笙;林浩然;;鲤鱼肝胰脏cDNA文库的表达序列标签分析及Lb-Fabp mRNA的特征(英文)[J];水生生物学报;2009年03期

2 闫世江;刘洁;司龙亭;马志国;杨佳明;;黄瓜种子含油量与耐低温性的关系[J];华北农学报;2007年S2期

3 陈文波;李卫国;;两种鲤鱼胰凝乳蛋白酶原基因的电子克隆及分析[J];生物技术通报;2011年01期

4 傅睿清;高山;许端祥;林碧英;;瓠瓜耐低温相关生理指标的研究[J];福建热作科技;2008年03期

5 杨佳明;司龙亭;闫世江;马志国;;黄瓜耐低温相关指标的初步研究[J];安徽农业科学;2007年03期

6 张建军;闫世江;王浩;司龙亭;马志国;杨佳明;;黄瓜种子脂肪酸含量与耐低温性关系的研究[J];安徽农业科学;2008年12期

7 宋宇轩,曹斌云;表达序列标签(ESTS)及其应用[J];家畜生态学报;2004年04期

8 刘春燕,陈庆山,辛大伟,邱红梅,单大鹏;大豆花叶病毒侵染初期的抗病性表达序列标签分析[J];作物学报;2005年11期

9 金庆超;董海涛;彭友良;陈保善;邓晔;戴承恩;方永启;邵菁;娄沂春;李有志;李德葆;;稻瘟病菌发育cDNA文库构建与表达序列标签分析[J];农业生物技术学报;2006年06期

10 陈卓;刘杰;钱万强;孙杰;沈继红;林学政;王能飞;;表达序列标签(EST)分析及藻类EST文库的研究进展[J];安徽农业科学;2009年05期

相关会议论文 前10条

1 姜润深;杨宁;徐桂云;王小亮;;笼养条件下丝羽乌骨鸡的就巢性状[A];第四届中国畜牧科技论坛论文集[C];2009年

2 许瑾璐;张文开;梁发超;;建设用地变化驱动力分析——以福州市为例[A];福建省土地学会2009年年会论文集[C];2009年

3 范秦海;李倩;;跳远起跳阶段起跳腿的运动特征及对起跳效果影响的相关分析[A];第十三届全国运动生物力学学术交流大会论文汇编[C];2009年

4 刘桂玲;奚隽;夏昕;;上海外来人员影响趋势及其与安全生产事故的相关分析[A];中国职业安全健康协会2010年学术年会论文集[C];2010年

5 李欣;;我区地方税收与经济增长的相关分析[A];北京市第十一次统计科学讨论会论文选编[C];2001年

6 孙红梅;李天来;李云飞;;低温解除休眠过程中百合鳞茎内的物质代谢及相关分析[A];科技、工程与经济社会协调发展——中国科协第五届青年学术年会论文集[C];2004年

7 李桂红;;前期气温场与江淮梅雨的相关性分析[A];第三届湖北省科技论坛气象分论坛暨2005年湖北省气象学会学术年会学术论文详细文摘汇集[C];2005年

8 温娟娟;;大专生的自我和谐性发展水平与父母教养方式的相关研究[A];第十届全国心理学学术大会论文摘要集[C];2005年

9 郑宗生;吴述尧;何传启;;生活质量与国家创新能力的相关性分析[A];第四期中国现代化研究论坛论文集[C];2006年

10 康邵钧;徐凤梅;宁德峰;陈新民;;商丘紫外线辐射变化特征及与若干气象因子相关分析[A];中国气象学会2006年年会“大气成分与气候、环境变化”分会场论文集[C];2006年

相关重要报纸文章 前10条

1 杨岭;原创动漫领跑2007少儿出版[N];中国图书商报;2007年

2 刘志英;小鲤鱼 大手笔[N];中国图书商报;2007年

3 公共营养师 李靖婷;鲤鱼芡实治湿疹[N];医药养生保健报;2006年

4 周宁记者站 吴仙友 张家灼;“回归工程”助推周宁旅游业发展[N];闽东日报;2007年

5 刘淑新;鲤鱼繁殖方法[N];云南科技报;2008年

6 本报记者 周海霞;供需失衡,梨城肉价有跌有涨[N];巴音郭楞日报;2007年

7 韩素芹;水产养殖 春季如何提高鲤鱼繁殖率[N];福建科技报;2006年

8 ;冬钓鲤鱼[N];西藏日报;2001年

9 张建;“小鲤鱼”能否续写“哪吒传奇”[N];中国图书商报;2007年

10 李艺 虞玮 陈柳 金新安;体育运动把生活变成节日[N];温州日报;2006年

相关博士学位论文 前10条

1 李滢;基于高通量测序技术的药用植物表达序列标签系统的构建与应用[D];中国协和医科大学;2010年

2 叶继丹;喹乙醇对鲤鱼的生理生化效应及其在组织中的残留[D];东北农业大学;2003年

3 于海洋;牙鲆微卫星标记的筛选和美洲牡蛎抗病相关基因SNP的初步分析[D];中国海洋大学;2010年

4 赵志辉;鸡下丘脑组织和猪脂肪组织表达序列标签的研究与分析[D];中国人民解放军军需大学;2001年

5 李莲瑞;鲤鱼(Cyprinus carpio L.)外周血白细胞cDNA文库的构建和差异表达基因的筛选[D];吉林大学;2006年

6 武玉叶;超表达OsNHX1、AtDREB1A基因获得抗盐、耐低温黑麦草转基因株系[D];中国农业大学;2005年

7 王颖;人参叶和根cDNA文库构建及表达序列标签分析[D];东北师范大学;2007年

8 张新叶;杨树抗黑斑病相关基因表达谱分析[D];南京林业大学;2005年

9 张骞;红色毛癣菌孢子EST构建及基因表达谱分析[D];吉林大学;2007年

10 周超;八年级学生数学认知水平的检测与相关分析[D];华东师范大学;2009年

相关硕士学位论文 前10条

1 林娜;小麦新品种川农16品质性状杂种优势研究[D];四川农业大学;2005年

2 方蕾;我国上市公司债务期限结构的影响因素研究[D];武汉理工大学;2007年

3 李广周;重庆市产业集群与产业竞争力关系研究[D];重庆大学;2009年

4 孙增辉;企业生态伦理与营销绩效的相关性研究[D];石家庄经济学院;2009年

5 张翔;基于BSC的商业银行业务流程再造的执行体系及实证研究[D];东华大学;2005年

6 甄文栋;山东省城市酸沉降状况及成因研究[D];山东大学;2005年

7 安玉莲;产业集群与区域竞争力关系研究[D];中国海洋大学;2005年

8 卢瑜佳;学习型组织维度及其对企业绩效影响的研究[D];大连理工大学;2006年

9 蔡振华;洪水频率组合模型及工程应用研究[D];武汉大学;2005年

10 程艳萍;组织职业生涯管理对工作满意度的影响研究[D];大连理工大学;2006年



本文编号:2337957

资料下载
论文发表

本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/sousuoyinqinglunwen/2337957.html


Copyright(c)文论论文网All Rights Reserved | 网站地图 |

版权申明:资料由用户5c480***提供,本站仅收录摘要或目录,作者需要删除请E-mail邮箱bigeng88@qq.com